Iniziò a scattare foto quando a 16 anni ricevette una vecchia macchina fotografica in vetro 9x12 da suo nonno. Sviluppò le sue stampe nella cucina e nel bagno della sua famiglia e iniziò a guadagnare un po' di soldi vendendo foto ad amici e compagni di classe. Hoepker studiò storia dell'arte e archeologia dal 1956 al 1959 a Gottinga e a Monaco, dove gli fu insegnato come comprendere immagini e composizione. Mentre a scuola continuò a fotografare e vendere immagini per aiutare a finanziare la sua istruzione[3].
Dal 1960 al 1963 lavorò come fotografo per Münchner Illustrierte e Kristall, riferendo da tutto il mondo. Poi, nel 1964, iniziò l'attività di fotoreporter per Stern . Negli anni '70 lavorò come cameraman per la TV tedesca, realizzando film documentari. Nel 1976 lui e la sua prima moglie, la giornalista Eva Windmoeller, si trasferirono a New York come corrispondenti per Stern. Dal 1978 al 1981 fu direttore della fotografia per American Geo. Dal 1987 al 1989 Hoepker visse ad Amburgo, lavorando come art director per Stern[4]. Ritornò poi negli USA.
Magnum Photos iniziò a distribuire le fotografie di Hoepker nel 1964. Egli diventò membro della Magnum a pieno titolo nel 1989. Ne ricoprì l'incarico di Presidente dal 2003 al 2006[5].
Dopo aver sposato la sua seconda moglie Christine Kruchen, con la quale realizzò documentari televisivi, visse a New York. Morì a Santiago del Cile l'11 luglio 2024 a causa di complicazioni della malattia di Alzheimer.
Libri
Jugend in dieser Zeit, Steingrüben, Germania, 1957
Finlandia, Terra Magica, Germania, 1960
Lebendiges Kiel, Presseamt der Stadt Kiel, Germania, 1963
Yatun papa. Padre degli indiani. Dr. Theodor Binder, Kosmos, Germania, 1963
Horst Janssen, ritratti dell'artista, Galerie Brockstedt, Germania, 1967
Die Iren und ihre Lieder, (Gli irlandesi e le loro canzoni), Germania, 1974
Berliner Wände, C. Hanser, Germania, 1976
Heinz Mack, Expedition in künstliche Gärten. Art in Desert and Ice, Sternbuch, Germania, 1977
Vienna, Libri Time / Life, Olanda, 1978
Thomas Höpker (I Grandi Fotografi), Rizzoli, Italia, 1983
Die New York-Story, GEO Buch, Germania, 1983
Adesso! Überdosis New York / HA Schult., Germania, 1984
Der Wahn vom Weltreich: ex colonie tedesche, Sternbuch, Germania, 1984
Ansichten.Fotos von 1960 bis 1985, Braus, Heidelberg, Germany, 1985
Leben in der DDR. Vita nella Germania orientale, Sternbuch, Germania, 1985
Amerika: storia della scoperta dalla Florida al Canada, Germania, 1986
HA Schult, New York, Berlino, Germania, 1986
Newyorkese: 50 ritratti insoliti, Stemmle, Sciaffusa, Germania, 1987
Roma, Hofmann & Campe, Germania, 1988
HA Schult, Fetisch Auto, Germania, 1989
Land of Enchantment, New Mexico, Philip-Morris books, Germany, 1991
Il ritorno dei Maya: il Guatemala. A Tale of Survival, Henry Holt, USA, 1998. ISBN 978-1-899235-81-0
Thomas Hoepker, Photographien 1955-2005, Schirmer & Mosel, Germania, 2005. ISBN 978-3-8296-0219-8