Het zwaarpunt van Dittenbergers onderzoek lag in het gebied van de Griekse epigrafie. Zijn naam is vooral verbonden met de bloemlezingen Sylloge inscriptionum Graecarum (later herwerkt door Friedrich Hiller von Gaertringen) en Orientis Graeci inscriptiones selectae. Voor de Inscriptiones Graecae (tegenhanger van Corpus Inscriptionum Latinarum) gaf Dittenberger de inscripties uit van Attica in de Romeinse tijd, van Megaris en Boeotië alsook van Phokis, Lokris, Aetolië, Acarnanië en de Ionische eilanden.