A primeira temporada de Marvel's Agents of S.H.I.E.L.D., ou simplesmente Agents of S.H.I.E.L.D., é uma série de televisão americana desenvolvida por Joss Whedon, em colaboração com Jed Whedon e Maurissa Tancharoen, com base na organização S.H.I.E.L.D. da Marvel Comics. É produzido pela Marvel Studios e é transmitida no canal ABC, fazendo parte do Universo Marvel Cinematográfico. A série gira em torno do personagem Phil Coulson, interpretado por Clark Gregg, que misteriosamente voltou a vida. O piloto, escrito por Joss Whedon, Jed Whedon e Maurissa Tancharoen, e dirigido por Joss Whedon, foi filmado no início de 2013 e o primeiro episódio foi ao ar em 24 de setembro de 2013. A primeira temporada da série teve 22 episódios.
Sinopse
Em sequência ao seu papel no campeão das bilheterias Os Vingadores, o agente Phil Coulson retorna para a S.H.I.E.L.D., a organização de execução da lei. Ali, ele monta um pequeno e altamente treinado grupo de agentes para lidar com o estranho e o desconhecido, em casos que ainda não foram classificados. O time é formado pelo focado agente Grant Ward, um especialista em combate e espionagem; a agente Melinda May, uma piloto e perita em artes marciais; o agente Leo Fitz, um cientista brilhante, porém um pouco deslocado socialmente; e a agente Jemma Simmons. Eles serão auxiliados pela nova recruta civil Skye, conhecida por sua especialidade como hacker de computadores. Prepare-se para uma aventura épica que destaca a esperança e o milagre que é o espírito humano. Este é um mundo de super-heróis e alienígenas.
Após a Batalha de Nova York, a existência dos super-heróis e alienígenas não é mais segredo, o que significa que o mundo está tentando lidar com esta nova realidade. O agente Phil Coulson está de volta e de olho em um grupo misterioso chamado “The Rising Tide”. Para encontrar este inimigo desconhecido, ele organiza um pequeno e supersecreto grupo de agentes altamente treinados cuja primeira missão é encontrar um homem comum que ganhou poderes extraordinários, capazes que trazer consequências devastadoras.
Skye esta agora integrada na equipe de Coulson, como consultora. Sua próxima missão é no Peru, rastreando um 0-8-4, um código S.H.I.E.L.D. para um objeto de origem desconhecida. Uma vez lá, a equipe rapidamente percebe que o objeto é um pedaço da esquecida tecnologia da Hidra, alimentado por energia do Tesseract. Coulson reúne-se com uma antiga colega e oficial no exército peruano, Camilla Reyes, e traz sua equipe a bordo de seu avião, o ônibus. Reyes trai Coulson para tirar a arma da Hidra para seu governo, assim eles podem derrotar os rebeldes peruanos. Os membros da equipe, juntos, conseguem tiram os homens do Reyes do avião. Quando o avião pousa em uma base da S.H.I.E.L.D., Reyes é levada em custódia. Mais tarde, o diretor Nick Fury repreende Coulson pelos danos ao avião e o avisa do risco de Skye estar lá.
S.H.I.E.L.D. procura por um dos seus cientistas, Dr. Franklin Hall, que foi sequestrado por Ian Quinn, líder da Quinn Worldwide, usando um dispositivo baseado na gravidade. Quinn quer usar a sala para tomar o controle da gravidade através da construção de um gerador de gravitonium gigante. Skye esta indo para Malta com a equipe, voluntária para se infiltrar na mansão de Quinn durante uma festa para que Coulson e Ward possam resgatar Hall. Skye faz Quinn acreditar que ela está traindo a S.H.I.E.L.D. No entanto, Coulson logo descobre que Hall planejou a própria fuga a fim de encontrar o gravitonium junto com o gerador e destruir ambos. Coulson adverte a ele que ao fazer isso acabaria matando milhões. Sua discordância violenta força Coulson a mandar Hall para o gerador, aparentemente ele sofre vaporização, mas desligando a máquina ao mesmo tempo. Coulson ordena que o gravitonium seja colocados sob alta segurança da S.H.I.E.L.D. e fora dos livros; no entanto, S.H.I.E.L.D. não persebe que Hall está de alguma forma vivo dentro do gravitonium.
Coulson e sua equipe investigam uma série de roubos de diamante pela antiga protegida de Coulson, Akela Amador, que está sendo chantageada por um manipulador desconhecido usando um explosivo olho cibernético.
Uma garota ardilosa em um vestido florido pode ter a chave para o mistério que leva Coulson e sua equipe para a Ásia para resgatar um jovem com um poder incomum e perigoso.
Segredos perigosos estão sendo mantidos em segredo para o time de Coulson, portanto ele trabalha ao redor do sistema para salvar Ward e Fitz quando esses são enviados para uma missão secreta nível 8 que pode terminar em tragédia.
Seguindo os eventos de Thor: O Mundo Sombrio, Coulson e os Agentes da S.H.I.E.L.D. recuperam as peças perdidas de um artefato Asgardiano e uma delas ameaça destruir um membro do time.
Coulson leva a guerra de volta a Centopeia, ao mesmo tempo em que traz Mike Peterson como reforço. Enquanto se aproximam da verdade, segredos surpreendentes são revelados e uma virada surpreendente ameaça o time.
Coulson descobre uma informação vital a respeito do mistério da sua morte. No entanto, com a Centopéia em busca de sangue, seu conhecimento pode custar a vida de um dos membros da equipe.
Perseguindo intensamente os rastros do Clarividente, Coulson e sua equipe embarcam num trem misterioso que parece ter como destino a morte certa. OBS: É nesse episódio que temos o cameo de Stan Lee.
Coulson toma atitudes para salvar Skye e pede a ajuda do ex-companheiro de Ward das operações especiais, John Garrett. No processo, ele descobre verdades chocantes não apenas sobre a S.H.I.E.L.D., mas também sobre sua própria vida.
Quando Coulson e seu time são atacados por Lorelei — uma sedutora perigosa que escapou de Asgard — Lady Sif, do universo de Thor e inimiga de longa data da vilã, chega para tentar salvar a todos.
Os agentes Garrett e Triplett estão de volta para ajudar a equipe de Coulson a rastrear o principal inimigo da S.H.I.E.L.D. - o Clarividente. Mas será que Deathlok irá destruir todos eles para proteger a identidade do seu mestre?
Após os eventos de Capitão América 2: O Soldado Invernal, Coulson e sua equipe percebem que não podem confiar em ninguém e descobrem que há um traidor entre eles.
Com o coronel Glenn Talbot em seu encalço, Coulson e o time procuram refúgio no último lugar que alguém poderia procurar, onde eles começam a descobrir os mais perigosos segredos da S.H.I.E.L.D., algo capaz de destruir a todos.
Com seu mundo virado de cabeça para baixo, Coulson corre para salvar a vida de seu único e verdadeiro amor na medida em que o mistério sobre a sua violoncelista começa a ser revelado.
Justo quando não há ninguém mais em quem se possa confiar, a agente Maria Hill volta para se unir a Coulson, enquanto a S.H.I.E.L.D. é destruída ao redor deles.
A traição de Ward e os chocantes segredos da HYDRA são revelados enquanto a equipe de Coulson entra em uma missão secreta que não deixa ninguém escapar ileso.