Após seu trabalho na Apple (de Agosto de 1979 e Março de 1984), Andy co-fundou três outras empresas: Radius, em 1986, General Magic, em 1990, e Eazel, em 1999. Em 2002 ele colaborou com Mitch Kapor na promoção de softwares de código aberto através da Open Source Applications Foundation. Em 2005, Andy passou a trabalhar para o Google, lá permanecendo desde então.
Seu cartão de visitas na Apple Inc. tinha como sua função "Gênio de Software". Ele escreveu grande parte do software de sistema original do Macintosh, incluindo grande parte do código da ROM do equipamento, a Caixa de Ferramentas da Interface do Usuário e diversos componentes inovadores que se tornariam padrão em diversas interfaces gráficas, como o Painel de Controle e o Scrapbook.
Depois de sair da Apple Inc. em 1984, Andy co-fundou três empresas: Radius, em 1986, General Magic, em 1990, e Eazel, em 1999. Na Eazel, Andy ajudou a criar o gerenciador de arquivos Nautilus para o ambiente GNOME do Linux. Ele se ofereceu como voluntário para a OSAF em 2002 e 2003, escrevendo protótipos de um software de gerenciamento de informações. Em 1996, Andy foi entrevistado por Robert Cringely no programa de TV Triumph of the Nerds, e novamente em 2005 por Cringely na NerdTV.
No começo de 2004 criou o site folklore.org, um site dedicado a contar histórias sobre o desenvolvimento do Macintosh original. As histórias foram editadas em um livro, Revolution in the Valley, publicado pela editora O'Reilly em Dezembro de 2004. Em Agosto de 2005 Andy se juntou à Google[1].