Repetindo-se o formato do ano anterior,exceto os torneios de consolação que não serão disputados, os participantes foram divididos em dois grupos. Na primeira fase (Taça JK), os times jogam contra os do outro grupo e o primeiro de um grupo enfrenta o segundo do outro numa semifinal. Os vencedores irão para a final do turno,em ida e volta, o vencedor dessa final, torna-se o campeão da Taça JK de 2013.
Na segunda fase (Taça Mané Garrincha), os times jogam dentro de seus grupos , embora a classificação seja dentro de cada grupo. O primeiro de um grupo enfrenta o segundo do outro numa semifinal. Os vencedores se enfrentam na final do turno,também em ida e volta, o vencedor do confronto será declarado o campeão da Taça Mané Garricha de 2013.
Os vencedores de cada turno disputam entre si dois jogos finais para estabelecerem o campeão brasiliense. Caso a mesma equipe vença os dois turnos, será declarado campeão automaticamente. Os três primeiros colocados tem o direito de disputar a Copa do Brasil de 2014.
Critérios de desempate
Para o desempate entre duas ou mais equipes segue-se a ordem definida abaixo# Número de vitórias
Para a definição da classificação geral, excluem-se os pontos obtidos nas fases semifinal e final de cada turno. Ao final do campeonato, o campeão e o vice-campeão ocuparão a primeira e segunda colocações independente do número de pontos.[3]
^a. Conforme o regulamento, após as finais, o campeão e vice-campeão deverão ocupar, respectivamente, a primeira e a segunda colocação na classificação geral.
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