Na primeira fase, as doze equipes enfrentam-se em turno e returno dentro de seus próprios grupos. As quatro melhores de cada chave se classificam, enquanto os dois sextos colocados são rebaixados. Na segunda fase, os oito times dividem-se novamente em dois grupos e se enfrentam em turno e returno. Classificam-se para as semifinais os dois melhores de cada grupo.
A semifinal será em jogo único e a decisão com jogos de ida e volta. No caso de empate em pontos, vale o saldo de gols e, persistindo a igualdade, a decisão de vaga ou título vai para a disputa de pênaltis. O campeão e o vice representarão Mato Grosso na Copa do Brasil de 2018 e o campeão na Copa Verde de 2018. Já os dois melhores colocados ganharão vaga no Série D de 2018.[1]
Critério de desempate
Os critério de desempate foram aplicados na seguinte ordem:
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