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No clube, existem departamentos que englobam futebol e atletismo. Fundado em 1994, o clube celebrou seu décimo aniversário em 2004. A equipe conquistou seu único título no campeonato regional em 2005 e alcançou a sexta posição no grupo A do campeonato nacional. Recentemente, o Flor Jovem terminou em terceiro lugar na segunda fase, somando 7 pontos na temporada 2014-15, e ficou em nono nas temporadas 2015-16 e 2016-17.
