Celebrada pela primeira vez em 1958, originalmente chamava-se Harelbeke-Anvers-Harelbeke devido ao itinerário de ida e volta da carreira, mas tomou o nome E3 pela autopista E3 —agora A14— que se construiu em meados dos anos sessenta.[1]
A primeira edição teve lugar em 1958, ainda que tem tido eventos similares na área desde 1955. A sua denominação inicial era Harelbeke-Anvers-Harelbeke. Também se chegou a conhecer como o GP E3 Harelbeke. Definitivamente atingiu o seu nome à conclusão das obras da próxima autopista E3 (agora A14), construída em meados dos anos sessenta. A partir da 54 ª edição, a última disputada em 2011 a palavra "Prijs" (Prêmio) eliminou-se da sua denominação e a prova como tal é conhecida como E3 Harelbeke. Em 2019, com a entrada de BinckBank como patrocinador, teve uma nova mudança de denominação e passou a chamar-se E3 BinckBank Classic.[2]
Até 2011, a carreira celebrou-se era levado a cabo no sábado. Quando ascendeu de categoria a UCI World Tour em 2012, a carreira se transladou às sextas-feiras para ter ao menos um dia de descanso entre a mesma e a outra prova de pavé da zona de categoria World Tour, a Gante-Wevelgem, que se celebra no último domingo do mês de março.