O imperador D. Pedro I entregando ao médico, professor e então diretor da Escola de Anatomia, Medicina e Cirurgia do Rio de Janeiro, Vicente Navarro de Andrade, o decreto que autoriza as instituições de ensino a emitirem diplomas aos médicos formados no Brasil.
Em 1856 a Faculdade foi transferida do Hospital Militar do Morro do Castelo para o prédio do Recolhimento das Órfãs, próximo à Santa Casa de Saúde do Rio de Janeiro, para finalmente em 12 de outubro de 1918 ganhar o seu próprio prédio no campus da Praia Vermelha, entre os atuais bairros da Urca e de Botafogo, na privilegiada zona sul da cidade. O prédio do Recolhimento das Órfãs, tendo abrigado a Faculdade de Medicina por mais de meio século, passou a chamar-se Instituto Anatômico, onde até meados da década de 1960 aulas ainda eram ministradas.
No dia 7 de setembro de 1920, quando do decreto que criava a Universidade do Rio de Janeiro, a Faculdade de Medicina deixou de ser uma instituição isolada. Teve o seu nome novamente mudado em 1937, com a criação da Universidade do Brasil, para Faculdade Nacional de Medicina. A 23 de Outubro de 1959, a então Faculdade de Medicina da Universidade do Brasil foi feita Comendadora da Ordem Militar de Cristo.[3] Quando, em 1965, a Universidade do Brasil passou a chamar-se Universidade Federal do Rio de Janeiro, a Faculdade Nacional de Medicina passou a ser somente a Faculdade de Medicina da UFRJ.
Em 1973, com a criação da Cidade Universitária na Ilha do Fundão, foi determinada a transferência da Faculdade de Medicina para lá, local em que permanece até hoje.
Notáveis alunos
Placa com os nomes dos formandos da 60ª turma da então Faculdade Nacional de Medicina em 1958.
