Преемник с 1723 года своего дяди Иосифа Климента. Унаследовав епископства Падерборн, Мюнстер, Кёльн, Хильдесхайм и Оснабрюк и став гроссмейстером Тевтонского ордена, Климент объединил под своей властью огромные территориальные владения в северо-западной Германии и стремился использовать своё влияние для возвышения баварского дома.
Климент деятельно помогал брату и в выборе его в императоры (Карл VII), и в походе на Австрию, пока союзное англо-австрийское войско не вынудило его не только к нейтралитету, но и к войне с его постоянными союзниками — французами, которым он не дал напасть на Ганновер.
После смерти Карла VII и примирения Баварии с Австрией, Климент при избрании императора подал голос за Франца Лотарингского, но вскоре опять примкнул к французской политике и в Семилетней войне был противником Пруссии.
