До 2009 года участвовал в любительских и региональных соревнованиях. В 2009 году занял 3 место в зоне «Юг»ЛФЛ. В сезоне-2010 включён в состав первенства второго дивизиона, зона «Юг».
В 2009 году Андрющенко учредил некоммерческую организацию «Детско-юношеская спортивная школа «Футбольный клуб „Митос“»». Фактически школа занятий с детьми не проводила. В июле 2018 года над Андрющенко был начал судебный процесс. По версии следствия, он попросил у ГАУ «Государственная экспертиза проектной документации и результатов инженерных изысканий» оказать ей благотворительную помощь. Выделенные ему 18 млн рублей Андрющенко якобы потратил на нужды подконтрольных ему фирм[3].
В сезоне 2013/14 клуб добился своего лучшего результата в Кубках России, дойдя до 1/32 финала, где проиграл белгородскому «Салюту».
8 апреля 2017 года РФС исключил ФК «МИТОС» из своих рядов[5].
Участие в трансферных сделках клубов Премьер-лиги
Весной 2011 года состоялся переход футболистов московского «Спартака» Максима Григорьева и Дмитрия Маляки в «Ростов» через «МИТОС» («МИТОС» сразу отдал их в аренду «Ростову», футболисты не сыграли за «МИТОС» ни одного матча), при этом возникли вопросы к срокам заключения сделок. «Спартак» остался недоволен суммой компенсации за игроков, а московский «Локомотив» пострадал от Григорьева, который в первом своём матче за «Ростов» в матче с «Локомотивом» вышел на замену и забил гол, отобрав у железнодорожников два очка[6][7][8].
