↑ Количество игр и голов за профессиональный клуб считается только для различных лиг национальных чемпионатов, обновлено по состоянию на 26 декабря 2024 года.
↑ Количество игр и голов за национальную сборную в официальных матчах, обновлено по состоянию на 20 ноября 2024 года.
Нуньес — воспитанник клуба «Пеньяроль». 22 ноября 2017 года в матче против «Ривер Плейта» он дебютировал в уругвайской Примере[2]. В своём дебютном сезоне Нуньес стал чемпионом Уругвая. 13 октября 2018 года в поединке против столичного «Феникса» Дарвин забил свой первый гол за «Пеньяроль»[3]. В том же году он завоевал Суперкубок Уругвая.
Летом 2019 года Нуньес перешёл в испанскую «Альмерию», подписав контракт на 5 лет. 3 октября в матче против хихонского «Спортинга» он дебютировал в Сегунде[4]. 27 октября в поединке против «Эстремадуры» Дарвин забил свой первый гол за «Альмерию»[5].
13 июня 2022 года «Бенфика» объявила о продаже уругвайского нападающего в английский «Ливерпуль» за 75 млн евро (100 млн евро с учётом бонусов)[13]. Уругваец оказался самым дорогим игроком в истории клуба. 21 июля Нуньес впервые сыграл за Ливерпуль против Рб Лейпцига в товарищеском матче, оформив покер. Команда выиграла 0:5. 30 июля в матче за Суперкубок Англии против «Манчестер Сити» Нуньес дебютировал за основной состав[14]. В этом же поединке Дарвин забил свой первый гол за «Ливерпуль» и помог клубу выиграть трофей. 6 августа в матче против «Фулхэма» он дебютировал в английской Премьер-лиге[15]. 12 октября в матче Лиги Чемпионов в матче против «Рейнджерс» забил дебютный гол за «Ливерпуль» в рамках данного турнира.
В июне 2023 года, после ухода Роберто Фирмино, сменил свой игровой номер с 27-го на 9-й.
15 октября 2019 года в товарищеском матче против сборной Перу Нуньес дебютировал за сборную Уругвая[30]. В этом же поединке он забил свой первый гол за национальную команду.