В юности писал анакреонтическую и буколическую лирику, создал лирико-эпическую поэму «Победа при Хунине». «Песнь Боливару» (опубликована в 1825 году), которая принесла ему широкую известность.[2].
Активно участвовал в борьбе за независимость Эквадора[3].
9 октября 1820 года Ольмедо и поддерживавшие его патриоты объявили независимость Гуаякиля от Испании. Ольмедо был единственным президентом Свободного государства Гуаякиль. Впоследствии эта территория всё же была включена Симоном Боливаром в состав Великой Колумбии.
После свержения президента Хуана Хосе Флореса в июне 1845 года Хосе Хоакин де Ольмедо стал председателем Временного правительства Эквадора. Свой пост он оставил 8 декабря 1845 года, передав полномочия Висенте Рамону Роке.