Округ Рефухио был одним из первоначальных округов Республики Техас, когда она провозгласила независимость от Мексики в 1836 году. Он был назван в честь миссии Нуэстра-Сеньора-дель-Рефухио, располагавшейся недалеко от будущего округа.
География
По данным бюро переписи населения США площадь округа Рефухио составляет 2120 км², из которых 1995 км² — суша, а 125 км² — водная поверхность (5,95 %).