Верховья реки лежат в канадскомКвебеке, где она носит название Rivière Daaquam (и берёт начало из слияния двух речек в точке 46°24′18″ с. ш. 70°18′40″ з. д.HGЯO); название меняется в точке пересечения границы.
Сент-Джон в общем спокойная, полноводная река, за исключением нескольких участков, где она образует водопады: Гранд-Фолз (25 м.) и Бичвуд (18 м.), энергия обоих была использована для выработки электроэнергии.
Главные притоки:
левые — Тобик, берущий начало на Центральной возвышенности, Натуак, Кеннебекасис и короткая река Джемсег, по которой в Сент-Джон попадает сток из Гранд-Лейк, крупнейшего озера провинции Нью-Брансуик.
О реке Сент-Джон очень поэтично написал канадский писатель Хью Макленнан в своей книге «Семь рек Канады»:
Это самая короткая река из числа наших главных потоков; её длина всего 420 миль, а бассейн и вовсе невелик. Однако он предлагает такое разнообразие пейзажей, что любого иностранца каждые двадцать миль там ожидает сюрприз. Сент-Джон — интимная и красивая река. В ясные летние дни цвет её вод в нижнем течении определяется интенсивностью солнечного освещения: это может быть синева океана, голубизна дельфиниума или фиолетовый цвет глубокого трепетного оттенка. После внезапного дождя над рекой Арустук — притоком Сент-Джона — верховья последнего могут выглядеть таким же бурным потоком, как и Ред-Ривер, в то время как его нижнее течение останется по-прежнему чистым; в самом деле, глубина Сент-Джона постепенно заметно увеличивается, его течение настолько спокойно, что наносы, доставляемые с верховий, быстро оседают на дно, отчего вода в нижнем течении реки остаётся удивительно прозрачной. Заходы солнца нв плёсе Лонг-Рич величественны, как в глубоких фиордах Норвегии. На рассвете и вечерами окрестности некоторых знаменитых участков реки обретают мягкие пастельные оттенки, характерные для пейзажей Южной Англии.
Ниже Гранд-Бея река Сент-Джон устраивает самый большой сюрприз, на который не способна ни одна судоходная река в Америке: она подходит к месту, называемому «Двухсторонний водопад» — Ревирсибл-Фолс (это между городом Сен-Джон и его новостроящимся районом Ланкастер). Там в малую воду река спускается в залив Фанди по узкому глубокому руслу с перепадом высоты в пятнадцать футов. Но когда в заливе Фанди вздымается могучий прилив, солёные воды врываются в это ущелье и высоко поднимают уровень воды в самой реке. Высота прилива в заливе Фанди настолько велика, что в это время в реку могут заходить даже океанские танкеры[1].
