В 1955—1992 годах — архитектор, руководитель группы, главный архитектор проектов в Институте проектирования городского строительства Госстроя Литовской ССР.
С 1974 года — преподаватель кафедры архитектуры Государственного художественного института Литовской ССР, доцент (1974), профессор (1993), член сената Вильнюсской художественной академии.
Член-корреспондент (1979), действительный член АХ СССР (1988). Член Союза архитекторов СССР (1958). Член правления Союза архитекторов СССР (1975). Член Союза архитекторов Литовской ССР. Член Президиума правления Союза архитекторов Литовской ССР (1967). Академик Международной академии архитектуры (IAA) (1987).
Дворец художественных выставок (1967, Вильнюс, ул. Музеяус), ныне Центр современного искусства (ул. Вокечю)
Жилой район Лаздинай (1974, Вильнюс; совместно с В. Бредикисом; Ленинская премия, которую, помимо авторов проекта, получили также архитекторы В. К. Бальчюнас, Г. Валюшкис, строители А. Клейнотас, В. Шилейка[4])
Институт экономики сельского хозяйства (1978, Вильнюс)
Здание Правительства Литвы (строилось как здание ЦК КПЛ; 1982, Вильнюс, проспект Гедимина, 11)
↑Aušra Asauskienė.Vytautas Edmundas Čekanauskas(лит.). Vilnijos vartai. Vilniaus apskrities kraštotyra (2011). Дата обращения: 12 января 2015. Архивировано из оригинала 18 февраля 2015 года.
↑Каталог (неопр.). Дата обращения: 15 марта 2022. Архивировано 19 мая 2018 года.
Vytautas Edmundas Čekanauskas(англ.). Virtual Museum of Architecture. Architecture Center. Дата обращения: 12 января 2015.
Algimantas Mačiulis.Vytautas Edmundas Čekanauskas(лит.). Visuotinė lietuvių enciklopedija. Mokslo ir enciklopedijų leidybos centras (6 августа 2003). Дата обращения: 18 марта 2019.