В 1940 году Ватиканом без консультаций с нацистскими оккупационными властями Протектората Чехии и Моравии был назначен епископ чешской национальности. Оккупационные власти энергично протестовали и требовали назначения епископа немецкого происхождения. Ватикан отказался исполнить эту просьбу оккупационных властей, ссылаясь на принцип невмешательства светских властей в дела Церкви. Назначенный епископАнтонин Элчкнер не мог приступить к исполнению своих обязанностей и Святой Престол объявил кафедру епархии Ческе-Будеёвице sede vacante, в состоянии которой она была до 1947 года.
В 1950 году епископ Йозеф Глоух был арестован и находился в заключении до 1963 года. После освобождения власти ему было запрещено заниматься пастырской деятельностью до 1968 года.
