С потерей Ватикана и другой временной власти папы римского, кардиналы были поставлены в затруднительное положение. Они были вынуждены созвать Конклав в Венеции, что сделало Конклав последним до сегодняшнего времени проведённым вне Рима. Это следовало из постановления, выпущенного Пием VI в 1798 году, в котором было заявлено, что Конклав в такой ситуации будет проведен в городе, в котором живёт самое большое число кардиналов. Резиденцией Конклава был выбран Бенедиктинскиймонастырь Сан-Джорджо. Город, наряду с другими североитальянскими землями, находился в это время под господством Австрии, чей император согласился покрыть затраты на проведение Конклава.
Сначала в выборах приняло участие тридцать четыре кардинала, но позже прибыл кардинал Херзан фон Гарраш, который был также императорским специальным уполномоченным, и использовал вето императора Франца II дважды. Эрколе Консальви был почти единодушно выбран секретарём Конклава, он позже использует своё влияние на выбор нового папы.
С начала 30 ноября1799 года до марта 1800 года кардиналы не могли выбрать между тремя кандидатами. Карло Беллисоми казался уверенным победителем, с широкой поддержкой кардиналов, но был непопулярен среди австрийских кардиналов, которые предпочитали Маттеи, поэтому на Беллисоми было наложено вето. Конклав добавил третьего возможного кандидата кардинала Гиацинта Сигизмунда Гердила, но на него также было наложено вето Австрией. Поскольку Конклав тянулся третий месяц кардиналМори, предложил нейтрального Кьярамонти который, пользуясь мощной поддержкой секретаря Конклава, был избран папой.
Все еще из-за нахождения в Венеции, с папской коронацией поспешили. Из-за отсутствия папских сокровищ дворяне города сделали известную Папскую Тиару из папье-маше. Она была украшена их собственными драгоценными камнями. Кьярамонти был объявлен папой римскимПием VII и коронован21 марта. Австрийское правительство, которое все еще предпочитало Маттеи, отказалось от использования Сан-Марко, так что Пий VII был коронован в монастыре Сан-Джорджо.
Конклав проводился самым малым числом кардиналов с 1534 года, их было всего 34. Церковь (в частности, из-за разрушений революции) имела только всего 45 кардиналов, самое малое число начиная с 31 кардинала с 1513 года.
Конклав был также уникален и тем, что Австрийская империя, которая тогда включала и Венецию, наложила вето на двух кандидатов (это было одной из причин его продолжительности). Это была общепринятая практика католических властей Испании, Франции и Австрии — быть способными наложить вето на какого-либо кандидата на папство, который им не нравился.
R. Obechea, El Cardinel Lorenzana en el conclave de Venezia (1975).
Alberto Lumbroso, Ricordi e documenti sul Conclave di Venezia (1800) (Roma: Fratelli Bocca 1903).
Charles van Duerm, SJ, Un peu plus de lumière sur le Conclave de Venise et sur les commencements du Pontificat de Pie VII. 1799-1800 (Louvain: Ch. Peeters 1896).
Eugenio Cipolletta, Memorie politiche sui conclavi da Pio VII a Pio IX (Milano 1863).
Mémoires du Cardinal Consalvi (ed. J. Crétineau-Joly) seconde édition (Paris: Plon 1866), 217-288.
Charles Antoine Ricard (editor), Correspondence diplomatique et mémoires inédits du Cardinal Maury (1792-1817) (Lille 1891) I, 264-379.