З 1857 по 1861 роки Морган служив у банку «Данкан, Шерман & Кº» (Нью-Йорк). 1861 року одружився з Амелією Старджесс (1835—1862). Овдовівши, Морган вступив у 1865 році в другий шлюб з Френсіс Луїз Трейсі (1842—1924), яка народила 4 дітей: Луїзу Пірпонт Морган (1866—1946), Джека Пірпонта Моргана (1867—1943), Джульєтт Морган (1870—1952) і Енн Морган (1873—1952).
Після роботи в різних фірмах у 1871 році Морган став партнером у компанії «Дрексел, Морган & Кº» (спільно з Ентоні Дрекселом). Після смерті партнера в 1893 році фірма була перетворена на банкірський дім «Дж. П. Морган & Кº» (Нью-Йорк). У союзі із залежними від нього банками в Філадельфії, Парижі і Лондоні дім на той час являв собою одну з найбільших фінансових компаній у світі.
Банк Моргана контролював будівництво залізниць, брав участь у створенні сталеливарної компанії «Ю. Эс. Стіл корпорейшн», електротехнічної фірми «Дженерал Електрик», фінансував пасажирські перевезення в Атлантиці.
У 1907 році Морган попередив велику банківську кризу, зібрав пул приватних інвесторів для ліквідації банківської паніки.
Останню справу про спекуляції зброєю розслідувала комісія Конгресу, та Морган уникнув відповідальності, використавши зв'язки в уряді та зробивши внесок у 300 доларів офіційних відступних.
Ron Chernow: The House of Morgan. An American Banking Dynasty and the Rise of Modern Finance. Simon & Schuster, London 1990, XVII, 812 S., Ill., ISBN 0-671-71031-1
Lewis Corey: The house of Morgan. A social biography of the masters of money. Watt, New York 1930, 479 S., Ill.
Henry Justin Smith: John Pierpont Morgan, der Weltbankier. Die Geschichte seines Hauses. Vom Werden der grössten Wirtschaftsmacht Amerikas. Reissner, Dresden 1928.
John K. Winkler: Morgan, the magnificent. The life of J. Pierpont Morgan. Vanguard Press, New York 1930, ISBN 0-7661-4332-5