У 1938 році очолив «Динамо» (Миколаїв). З Кондратенко в 1938 році миколаївці завоювали бронзу чемпіонату УРСР. Ці бронзові медалі досі є найвищим досягненням клубу в розіграшах аматорських турнірів.
Після закінчення радянсько-німецької війни повернувся до роботи тренером. Спочатку він був асистентом цієї команди, що тепер носила назву «Суднобудівник», а в 1948 році, після 6-го туру, замінив Олександра Сердюка на чолі команди[1].