Був сином данського принца Генріка Скаделара та Інґрід, дочки Раґнвальда з роду Стенкілів. Тому він мав деякі права на трон Швеції. Для зміцнення своїх позицій він одружився з дочкою Гаральда IV Гілле, короля Норвегії. Маґнус Генрікссон сподівався на допомогу свого тестя при захопленні влади у Швеції.
У 1160 році Маґнус підступно вбив Еріка IX й захопив владу у Швеції. Проте відразу проти нього піднялися інші претенденти на шведську корону. Найсильнішим був ярл Геталанда Карл Сверкерсон, син короля Сверкера I. У 1161 році у битві при Еребру Маґнус II зазнав нищівної поразки й загинув у битві. Новим королем став Карл Сверкерсон.
Родина
Дружина — Бріґіта (1131—1209), дочка Гаральда IV, короля Норвегії.