Хосе Енріке почав футбольну кар'єру в клубі «Леванте», у 2005 році перейшов до «Валенсії». У «Валенсії» він провів лише місяць, оскільки незабаром після переходу був відправлений в оренду до «Сельти», за яку і зіграв свої перші 14 матчів в іспанській Прімері. Після закінчення терміну оренди Хосе Енріке був придбаний «Вільярреалом».
У сезоні 2007–2008 Хосе Енріке нерегулярно з'являвся в основному складі «Ньюкасла», оскільки тренер клубу, Сем Еллардайс, довіряв досвідченішим гравцям, зокрема використовував на позиції лівого захисника номінального півзахисника Шарля Н'Зогбія. У наступному сезоні Хосе Енріке частіше виходив в основному складі, проте загальні невдачі «Ньюкасла», який боровся за право залишитися у Прем'єр-лізі, і подальші зміни тренерів не дозволили йому в належній мірі проявити себе. За підсумками сезону «Ньюкасл Юнайтед» вилетів з Прем'єр-ліги, команду покинули багато провідних гравців. У придбанні Хосе Енріке був зацікавлений мадридський«Атлетіко», але реальної пропозиції не було[2]. Хоча спочатку він був зацікавлений у переході в «Атлетіко», пізніше іспанець заявив, що залишить «Сорок» лише у разі пропозиції від «Барселони»[3]. В результаті Хосе Енріке залишився в «Ньюкаслі». У сезоні 2009/10 він став переможцем Чемпіоншипа у складі «Ньюкасла» і увійшов до команди року цього турніру.
Сезон 2010–2011 років Енріке провів у Прем'єр-лізі, де «Ньюкасл» отримав право знову виступати. Влітку 2011 року Хосе виступив з різкою критикою керівництва клубу, яке дозволило покинути склад «сорок» цілому ряду ключових гравців, у тому числі молодому форвардові Енді Керролу та капітану команди Кевіну Нолану[4]. За це він був усунений від тренувань на два тижні.
«Ліверпуль»
Протягом всієї весни і перших місяців літа 2011 року ходили чутки про те, що Хосе Енріке влітку перейде в «Ліверпуля»[5][6][7]. У середині квітня екс-капітан «Ліверпуля» Філ Томпсон навіть заявив, що угода по трансферу гравця вже є[8]. Однак, тільки на початку серпня стало зрозуміло, що ймовірність цього трансферу дійсно велика[9], і 11 серпня2011 року Хосе Енріке перейшов до «Ліверпуля»[10].
За нову команду Енріке дебютував 13 серпня в матчі проти «Сандерленда», який закнічився з рахунком 1—1[11]. 20 серпня Енріке вдруге вийшов за нову «червоних», зігравши увесь матч проти «Арсенала». Після матчу, який завершився з рахунком 2—0 на користь «Ліверпуля», Хосе було названо найкращим гравцем матчу.
2 жовтня було оголошено, що вболівальники обрали гравця як найкраще придбання літнього міжсезоння. Хосе набрав 74,5% обійшовши Чарлі Адама та Крейґа Белламі.[12]
1 квітня 2012 року у матчі проти «Ньюкасл Юнайтед» після вилучення воротаря Пепе Рейни Хосе догравав матч на позиції голкіпера.[13]
17 листопада Хосе у домашньому матчі проти «Віган Атлетик» забив свій перш м'яч за «Ліверпуль».[14]