Giải bóng đá Cúp Quốc gia 1996 là mùa giải thứ năm của Giải bóng đá Cúp Quốc gia do Liên đoàn bóng đá Việt Nam (VFF) tổ chức, với sự tham gia của các câu lạc bộ bóng đá tại Việt Nam. Các đội tham dự được chia theo 3 khu vực, thi đấu vòng loại để chọn 8 đội vào vòng chung kết tại Thành phố Hồ Chí Minh. Giải khởi tranh từ tháng 8 năm 1996 và kết thúc vào ngày 5 tháng 12 năm 1996.
Các trận đấu vòng loại thuộc bảng C đã diễn ra từ ngày 21 tháng 8 đến ngày 4 tháng 9 năm 1996.[4] 16 đội tham dự chia cặp thi đấu chọn hai đội vào vòng chung kết.[5]
Vòng chung kết Cúp Quốc gia 1996 được tổ chức từ ngày 23 tháng 11 đến ngày 5 tháng 12 năm 1996 tại Sân vận động Thống Nhất, Thành phố Hồ Chí Minh. 8 đội bóng tham dự thi đấu theo thể thức đấu loại trực tiếp, được bắt cặp thi đấu hai lượt trận ở vòng tứ kết và một lượt trận ở bán kết và chung kết. Nếu tỷ số hòa, hiệp phụ (có áp dụng luật bàn thắng vàng) và loạt sút luân lưu (nếu cần) sẽ được sử dụng để quyết định đội thắng.