United bắt đầu mùa giải vào ngày 20 tháng 8 năm 2012 với trận đấu đầu tiên tại Premier League. Sau khi bỏ lỡ chức vô địch vào mùa giải trước, họ đã giành được danh hiệu vô địch nước Anh lần thứ 20 vào ngày 22 tháng 4 năm 2013 với chiến thắng trước Aston Villa tại Old Trafford, trong đó vua phá lưới Robin van Persie lập một cú hat-trick, hoàn thiện mùa giải với 26 bàn thắng tại Ngoại hạng Anh và 30 bàn tính trên mọi đấu trường.
Tại Cúp Liên đoàn Anh và Cúp FA, United để thua Chelsea trong 2 hai giải đấu. Chelsea thắng United với tỷ số 5-4 tại vòng thứ 4 Cúp Liên đoàn vào ngày 31 tháng 10 năm 2012, rồi tiếp tục đánh bại đội chủ sân Old Trafford 1–0 tại vòng 6 Cúp FA vào ngày 1 tháng 4 năm 2013.
Tại đấu trường châu Âu, United đã bị loại ra khỏi UEFA Champions League ở vòng 16, khi để thua Real Madrid với tổng tỷ số 3-2 sau hai lượt trận.
Ngày 8 tháng 5 năm 2013, huấn luyện viên Sir Alex Ferguson tuyên bố nghỉ hưu. Ông là huấn luyện viên của Manchester United sau gần 27 năm phụ trách và trở thành huấn luyện viên phụ trách lâu nhất của bất kỳ câu lạc bộ nào tại Anh ở giai đoạn này. Ông đã giành được 38 danh hiệu lớn trong khoảng thời gian đó, nhiều hơn bất kỳ huấn luyện viên nào khác trong lịch sử bóng đá Anh. Ở 71 tuổi, Sir Alex cũng là huấn luyện viên cao tuổi nhất tại Premier League hay Football League.
Ngày hôm sau, Manchester United thông báo rằng David Moyes của Everton sẽ tiếp quản chiếc ghế HLV từ đầu mùa giải 2013-14.
Trước mùa giải và giao hữu
Manchester United khởi động trước mùa giải 2012–13 với một tour du đấu toàn cầu, bao gồm các chuyến đi đến Nam Phi lần đầu tiên kể từ năm 2008, Trung Quốc lần đầu tiên kể từ năm 2009 và Na Uy lần đầu tiên kể từ năm 2002. Tour du đấu bắt đầu bằng trận đấu với 2 câu lạc bộ Nam Phi AmaZulu ngày 18 Tháng 7 năm 2012 và Ajax Cape Town vào ngày 21 Tháng 7 năm 2012.[1] Sau đó, họ di chuyển đến Trung Quốc để đá giao hữu với Thượng Hải Thân Hoa vào ngày 25 tháng 7 năm 2012 trên sân vận động Thượng Hải,[2] trước khi chuyển sang Na Uy để thi đấu với câu lạc bộ Vålerenga tại sân vận đông Ullevaal ở Oslo vào ngày 05 tháng 8,[3] và Thụy Điển để thi đấu với đại diện Tây Ban Nha là Barcelona ở Ullevi, Gothenburgand vào ngày 08 tháng 8 năm 2012.[4] Trận đấu cuối cùng của chuyến du đấu trước mùa giải là gặp Hannover 96 tại AWD-Arena vào ngày 11 Tháng 8 năm 2012.[5]
United bước vào Cúp FA ở giai đoạn vòng thứ ba với các câu lạc bộ khác Premier League, cũng như từ Championship. Lễ bốc thăm được thực hiện vào ngày 02 tháng 12 năm 2012, với các trận đấu diễn ra vào cuối tuần vào ngày 06 tháng 1 năm 2013. United đã được rút thăm trong một trận đấu sân khách trước West Ham United.[6] Trận đấu đã kết thúc trong trận hòa 2-2 có nghĩa là United phải đối đầu với West Ham United một lần nữa, lần này tại Old Trafford vào ngày 16 tháng 1 năm 2013, đánh bại họ 1-0 hành trình của giải đấu.
Lễ bốc thăm cho vòng thứ tư diễn ra vào ngày 06 tháng 1 năm 2013, và United được chơi trên sân nhà vào ngày 26 Tháng 1 khi tiếp đón Fulham,[7] và United thắng 4-1.
Lễ bốc thăm cho vòng thứ năm diễn ra vào ngày 27 Tháng 1 năm 2013, và United lại thi đấu trên sân nhà khi tiếp đón câu lạc bộ đang chơi ở Premier League là Reading.[8] Trận đấu diễn ra ngày 18 tháng 2 năm 2013 và United giành chiến thắng 2-1.[9]
Lễ bốc thăm cho vòng thứ sáu diễn ra vào ngày 17 tháng 2 năm 2013, và lại một lần nữa United được chơi trên sân nhà,[10] lần này tiếp đón vị khách Chelsea.[11] Trận đấu diễn ra vào ngày 10 tháng 3 năm 2013 đã kết thúc trong một trân hòa 2-2 đồng nghĩa với việc United phải đối đầu với Chelsea một lần nữa, lần này là tại Stamford Bridge vào ngày 01 tháng 4. Trận đấu đã kết thúc với United thua 1-0, có nghĩa là United đã bị đánh bật ra khỏi giải đấu FA Cup, còn với Chelsea tiếp tục phải đối mặt với Manchester City trong trận bán kết.
Là một trong bảy câu lạc bộ Anh đủ điều kiện để tham dự cúp châu Âu trong mùa giải 2011-12, United được đặc cách vào vòng thứ ba của League Cup. Lễ bốc thăm diễn ra vào ngày 30 Tháng 8 năm 2012, United gặp đại diện Premier League là Newcastle United.[12] United đánh bại Newcastle 2-1 vào ngày 26 tháng 9. Cuối ngày hôm đó United được rút thăm gặp Chelsea cho trận đấu vòng thứ tư.[13]
Sau khi đứng thứ nhì trong giải đấu của mùa giải năm ngoái, United bắt đầu giải đấu thi đấu vòng bảng của giải Champions League. Biếu không của họ hệ số United được UEFA xếp ở nhóm hạt giống và lễ bốc thăm diễn ra tại Monaco vào 30 tháng 8 năm 2012.[14] United nằm ở bảng H, cùng với Braga của Bồ Đào Nha, nhà vô địch Thổ Nhĩ Kỳ Galatasaray và Nhà vô địch Romania CFR Cluj.[15] Manchester United trước đó đã được rút ra với Galatasaray trong cả hai mùa giải 1993-94 và 1994-95, trong khi Braga và CFR Cluj là đối thủ mới.[16]
Lễ bốc thăm vòng 16 đã được thực hiện tại Nyon, Thụy Sĩ, vào ngày 20 tháng 12 năm 2012. Trận lượt đi được chơi trên sân khách vào ngày 13 tháng 2 năm 2013, và trận lượt về vào ngày 05 tháng 3 2013 tại Old Trafford. Là đội đứng thứ nhất bảng H, United được rút thăm gặp nhà vô địch giải đấu Tây Ban Nha là Real Madrid, đội bóng đứng thứ nhì trong bảng D.
^“Scholes set to retire”. ManUtd.com. Manchester United. ngày 11 tháng 5 năm 2013. Truy cập ngày 11 tháng 5 năm 2013.
^Bartram, Steve (ngày 2 tháng 7 năm 2012). “Fabio joins QPR on loan”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 2 tháng 7 năm 2012.
^Marshall, Adam (ngày 13 tháng 7 năm 2012). “Cofie links up with Blades”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 13 tháng 7 năm 2012.
^ abMarshall, Adam (ngày 3 tháng 1 năm 2013). “Duo return from loans”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 3 tháng 1 năm 2013.
^Coppack, Nick (ngày 20 tháng 7 năm 2012). “Brown becomes a Sky Blue”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 20 tháng 7 năm 2012.
^Marshall, Adam (ngày 7 tháng 1 năm 2013). “Brown back in Manchester”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 7 tháng 1 năm 2013.
^“Amos Loan Deal Completed”. hullcityafc.net. Hull City AFC. ngày 31 tháng 7 năm 2012. Bản gốc lưu trữ ngày 5 tháng 8 năm 2012. Truy cập ngày 31 tháng 7 năm 2012.
^ abMarshall, Adam (ngày 31 tháng 8 năm 2012). “Duo head to Royal Antwerp”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 31 tháng 8 năm 2012.
^Marshall, Adam; Bostock, Adam (ngày 6 tháng 11 năm 2012). “Brady goes back to Hull”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 6 tháng 11 năm 2012.
^ abcMarshall, Adam (ngày 5 tháng 12 năm 2012). “Reds trio extend loan deals”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 5 tháng 12 năm 2012.
^ abMarshall, Adam (ngày 6 tháng 11 năm 2012). “Duo tie up switch”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 6 tháng 11 năm 2012.
^Marshall, Adam (ngày 6 tháng 11 năm 2012). “McGinty heads to Carlisle”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 6 tháng 11 năm 2012.
^Hall, Andy (ngày 7 tháng 12 năm 2012). “Transfer: McGinty Loan Extended”. carlisleunited.co.uk. Carlisle United FC. Bản gốc lưu trữ ngày 12 tháng 5 năm 2014. Truy cập ngày 29 tháng 10 năm 2014. Đã định rõ hơn một tham số trong |accessdate= và |access-date= (trợ giúp)
^Marshall, Adam (ngày 22 tháng 11 năm 2012). “King joins Berg at Blackburn”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 22 tháng 11 năm 2012.
^Thompson, Gemma (ngày 3 tháng 1 năm 2013). “Boss hopes Bebe will blossom”. ManUtd.com. Manchester United. Truy cập ngày 3 tháng 1 năm 2013.