史温侯离开台湾后,对台湾的鸟类学研究重新陷入沉寂,进入台湾岛内进行考察的西方人很少,而台湾的鸟类学研究局限于对史温侯等人采集的标本和考察记录的研究,这种状况持续到鸟类学家拉图雪(John David Digues La Touche)1893年在台南开始的鸟类调查。拉图雪是继史温侯之后第二位在台湾进行深入研究的鸟类学家。他作为海关官员在中国居住30余年,先后三次赴台湾进行考察,出版了《华东鸟类手册》、《福尔摩莎鸟相》等专著。拉图雪的贡献包括,在台南和高雄详细记录了鸟类分布状况和鸟相,在鹅鑾鼻发现了短尾信天翁的繁殖地、详细调查了淡水的鸟相、发现兰屿的独特鸟相等。
1945年日本战败,中华民国政府光复台湾,在台的日本人,包括日籍鸟类学家,均返回日本,台湾的鸟类学研究又随着政治的变动进入一个新的时代。在日治时期,台湾人不能学习基础科学,从事鸟类学研究的台籍学者非常稀有,而中国的鸟类学研究在1940年代远不如日本之系统和深入,人才的匮乏使台湾的鸟类学研究进入一个为期20年有余的沉寂期。从1945年到1970年代中期,除了日籍学者在日本发表的一些关于台湾的鸟类学研究外,几乎没有其他研究问世。从1960年代开始,台湾的鸟类学研究开始复苏。1964年美军为研究迁徙性动物携带病原体的状况启动“东南亚迁徙性动物病理学调查计划”台湾作为计划的一部分开始进行鸟类环志工作。1970年,东海大学美籍教授欧保罗(Paul Stephen Alexander)等人在英文中国邮报上发表了介绍性文章《台湾鸟类指南》。之后东海大学与观光局开始在岛内推广观鸟活动,这使许多业余人士加入鸟类调查和鸟类学研究的领域,台湾的鸟类学研究逐渐复苏。1973年台北赏鸟会成立,开始有组织地进行一些鸟类观测活动,1984年正式注册为台北市野鸟学会,1988年中华民国野鸟学会注册成立。嗣后台湾各县市纷纷成立鸟会,鸟会也成为协调和组织业余观鸟者进行鸟类学研究的重要机构,一些规模较大的鸟会本身甚至直接承担多项研究课题。
^Hall, Philip B., "Robert Swinhoe (1836-1877), FRS, FZS, FRGS: A Victorian naturalist in treaty port China," The Geographical Journal 153, i (March 1987): 37; Otness, Harold M., One thousand westerners in Taiwan, to 1945: A biographical and bibliographical dictionary ([Taipei]: Institute of Taiwan History, Preparatory Office, Academia Sinica, 1999), p.39; Otness 1999, pp. 151-152. In contrast, George Carrington, in Foreigners in Formosa 1841-1874 (San Francisco: Chinese Materials Center, 1978), pp. 63-64, 108, maintains that Swinhoe made his first trip to Formosa in 1857 aboard the H.M.S Inflexible. This proposition is less likely due to the correspondence and quality of the Otness and the Hall articles. Presumably, Carrington mistook the vessel of this earlier trip for Swinhoe's subsequent 1858 trip to Formosa aboard the Inflexible.
^Carrington 1978, pp. 108, 110, 146; Hall 1987, p. 41; Otness 1999, p. 151; Yen, Sophia Su-fei, Taiwan in China's foreign relations, 1836-1874 (Hamden, CN: Shoe String Press, Inc., 1965), p. 96.
^Swinhoe, Robert, "The ornithology of Formosa, or Taiwan." The Ibis 5 (1863): 198-219, 250-311, 377-435.