Babak gugur diikuti oleh enam belas klub yang lolos dari babak grup.[1]
Selain pertadingan final, setiap babak memainkan sepasang pertandingan kandang-tandang. Hasil dari kedua pertandingan akan dijumlah kan untuk menentukan hasilnya. Jika terjadi hasil imbang, maka pemenang ditentukan dengan peraturan gol tandang, yakni klub yang mampu mencetak gol lebih banyak saat bermain di kandang lawan menjadi pemenangnya. Jika masih imbang, maka pertandingan kedua dilanjutkan dengan perpanjangan waktu, dalam dua babak masing-masing 15 menit. Jika kedua klub mencetak gol pada masa perpanjangan waktu sehingga hasilnya imbang, maka klub tandanglah yang menjadi pemenang. Jika tidak terjadi gol maka pemenang ditentukan dengan adu penalti.
Pada pertandingan final hanya akan melakukan satu pertandingan di tempat yang telah ditentukan sebelumnya, untuk final kali ini akan diselenggarakan di Stadion Wembley di London, Inggris. Jika skor imbang maka dilanjutkan dengan perpanjangan waktu, dan adu penalti jika masih imbang.
Pengundian babak gugur dilakukan dengan mekanisme berikut:
Untuk pengundian babak 16 besar, delapan juara grup menjadi unggulan sedangkan runner up grup maenjadi non-unggulan. Setiap klub unggulan akan bertanding melawan non-unggulan, dengan tim unggulan akan menjalani pertandingan kandang pada pertandingan kedua. Klub-klub dari grup yang sama atau asosiasi negara yang sama tidak akan dipertemukan.
Untuk pengundian babak perempat final dan seterusnya, tidak diberlakukan status unggulan dan non-unggulan dan klub-klub dari grup yang sama atau asosiasi negara yang sama dapat dipertemukan.
Tim yang lolos
Grup
Juara grup (Unggulan pada babak 16 besar)
Peringkat kedua (Non-unggulan pada babak 16 besar)
Pengundian babak 16 besar dilakukan pada 13 Desember 2013.[6] Leg pertama dimainkan pada 18, 19, 25 dan 26 Februari, dan leg kedua akan dimainkan pada 11, 12, 18 dan 19 Maret 2014.[7]
Pengundian semifinal akan dilakukan pada 11 April 2014.[34] Leg pertama akan dimainkan pada 22 dan 23 April, dan leg kedua akan dimainkan pada 29 dan 30 April 2014.[35]
