Sekretom

Sekretom adalah kumpulan protein yang diekspresikan oleh suatu organisme dan disekresikan ke dalam ruang ekstraseluler. Pada manusia, subset proteom ini mencakup 13-20% dari semua protein termasuk sitokin, faktor pertumbuhan, protein dan regulator matriks ekstraseluler, serta reseptor pelepasan. Sekretom jaringan tertentu dapat diukur dengan spektrometri massa dan analisisnya merupakan jenis proteomika yang dikenal sebagai sekretomika.

Definisi

Istilah "sekretom" diciptakan oleh Tjalsma dan koleganya pada tahun 2004 untuk menunjukkan semua faktor yang disekresikan oleh sel, bersama dengan konstituen jalur sekresi.[1] Pada tahun 2010, definisi sekretom ini direvisi untuk hanya mencakup protein yang disekresikan ke dalam ruang ekstraseluler.[2] Konsep terkait mencakup matrisom, yang merupakan bagian dari sekretom yang mencakup protein matriks ekstraseluler dan protein terkaitnya;[3] reseptom, yang mencakup semua reseptor membran,[4] dan adhesom, yang mencakup semua protein yang terlibat dalam adhesi sel.[5][6]

Kuantifikasi

Protein yang disekresikan pada manusia mencakup 13–20% dari seluruh proteom dan mencakup faktor pertumbuhan, kemokin, sitokin, molekul adhesi, protease, dan reseptor pelepasan.[2] Gen pengkode protein manusia (39%, 19613 gen[7]) diprediksi memiliki peptida sinyal dan/atau setidaknya satu daerah transmembran yang menunjukkan transpor aktif protein yang sesuai keluar dari sel (sekresi) atau lokasi di salah satu dari banyak sistem membran dalam sel. Bukti yang semakin meningkat menunjukkan bahwa selain muatan protein; komponen non-protein seperti lipid, mikro-RNA, dan RNA duta, juga dapat disekresikan oleh sel melalui mikrovesikel (diameter 100–>1000 nm), yang dilepaskan dari membran plasma dan eksosom (diameter 30–150 nm), yang dilepaskan melalui peristiwa eksositosis endosomal.[8] Faktor-faktor yang ada di kedua organel ini mencakup hingga 42% dari sekretom dan telah dimasukkan sebagai sekretom kolektif.[9] Ada beragam metodologi yang tersedia untuk mempelajari sekretom sel tumbuhan, sel manusia dan sel mamalia, sel punca, serta sel kanker.[9]

Referensi

  1. ^ Tjalsma, H.; Antelmann, H.; Jongbloed, J. D.H.; Braun, P. G.; Darmon, E.; Dorenbos, R.; Dubois, J.-Y. F.; Westers, H.; Zanen, G.; Quax, W. J.; Kuipers, O. P.; Bron, S.; Hecker, M.; van Dijl, J. M. (8 June 2004). "Proteomics of Protein Secretion by Bacillus subtilis: Separating the "Secrets" of the Secretome". Microbiology and Molecular Biology Reviews. 68 (2): 207–233. doi:10.1128/MMBR.68.2.207-233.2004. PMC 419921. PMID 15187182.
  2. ^ a b Agrawal GK, Jwa NS, Lebrun MH, Job D, Rakwal R (February 2010). "Plant secretome: unlocking secrets of the secreted proteins". Proteomics. 10 (4): 799–827. doi:10.1002/pmic.200900514. PMID 19953550. S2CID 20647387.
  3. ^ Hynes, R. O.; Naba, A. (21 September 2011). "Overview of the Matrisome--An Inventory of Extracellular Matrix Constituents and Functions". Cold Spring Harbor Perspectives in Biology. 4 (1) a004903. doi:10.1101/cshperspect.a004903. PMC 3249625. PMID 21937732.
  4. ^ Ben-Shlomo, I.; Yu Hsu, S.; Rauch, R.; Kowalski, H. W.; Hsueh, A. J. W. (17 June 2003). "Signaling Receptome: A Genomic and Evolutionary Perspective of Plasma Membrane Receptors Involved in Signal Transduction". Science Signaling. 2003 (187) re9. doi:10.1126/stke.2003.187.re9. PMID 12815191. S2CID 12803444.
  5. ^ Zaidel-Bar, Ronen; Itzkovitz, Shalev; Ma'ayan, Avi; Iyengar, Ravi; Geiger, Benjamin (August 2007). "Functional atlas of the integrin adhesome". Nature Cell Biology. 9 (8): 858–867. doi:10.1038/ncb0807-858. PMC 2735470. PMID 17671451.
  6. ^ Horton, Edward R.; Byron, Adam; Askari, Janet A.; Ng, Daniel H. J.; Millon-Frémillon, Angélique; Robertson, Joseph; Koper, Ewa J.; Paul, Nikki R.; Warwood, Stacey; Knight, David; Humphries, Jonathan D.; Humphries, Martin J. (19 October 2015). "Definition of a consensus integrin adhesome and its dynamics during adhesion complex assembly and disassembly". Nature Cell Biology. 17 (12): 1577–1587. doi:10.1038/ncb3257. PMC 4663675. PMID 26479319.
  7. ^ Uhlén M, Fagerberg L, Hallström BM, Lindskog C, Oksvold P, Mardinoglu A, et al. (January 2015). "Proteomics. Tissue-based map of the human proteome". Science. 347 (6220) 1260419. doi:10.1126/science.1260419. PMID 25613900. S2CID 802377.
  8. ^ Xu R, Greening DW, Zhu HJ, Takahashi N, Simpson RJ (April 2016). "Extracellular vesicle isolation and characterization: toward clinical application". The Journal of Clinical Investigation. 126 (4): 1152–62. doi:10.1172/JCI81129. PMC 4811150. PMID 27035807.
  9. ^ a b Mukherjee P, Mani S (November 2013). "Methodologies to decipher the cell secretome". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteins and Proteomics. 1834 (11): 2226–32. doi:10.1016/j.bbapap.2013.01.022. PMC 3652893. PMID 23376189.

Bacaan lanjutan

Content Disclaimer

Informasi ini disarikan dari Wikipedia dan disajikan kembali untuk tujuan edukasi. Konten tersedia di bawah lisensi CC BY-SA 3.0. Kami tidak bertanggung jawab atas ketidakakuratan data yang bersumber dari kontribusi publik tersebut.

  1. The information displayed on this website is sourced in part or in whole from Wikipedia and has been adapted for the purpose of restating it. We strive to provide accurate and relevant information, however:
  2. There is no guarantee of absolute accuracy. Wikipedia is an open, collaborative project that can be edited by anyone, so information is subject to change.
  3. It is not intended to constitute professional advice. The content displayed is for informational and educational purposes only. For important decisions (e.g., medical, legal, or financial), please consult a professional.
  4. Content copyright. Wikipedia is licensed under the Creative Commons Attribution-ShareAlike License (CC BY-SA). This means that content may be reused with appropriate attribution and shared under a similar license.
  5. Responsible use. Any risk arising from the use of information from this website is entirely the responsibility of the user.