السكر النادر (بالإنجليزية: Rare sugar) هو السكر الذي يوجد بكميات قليلة في الطبيعة.وهي توجد نموذجيا بكميات قليلة جدا لا تسمح باستخلاصها لغايات اقتصادية من مصادرها الطبيعية الدفينة والمستبطنة وهي تنتج بشكل نموذجي عن طريق العمليات الحيوية كالتخمر أو التحول الإنزيمي لتكوين مركب مماثل.