Issu d'une famille d'artistes serruriers, il fait ses études au collège d'Orléans pour se consacrer ensuite tout entier à des travaux littéraires. Après une première pièce de théâtre en 1841, et quelques feuilletons parus dans le journal Le Loiret en 1842, il publie de très nombreuses études historiques, littéraires, bibliographiques et théâtrales. Il édite de nombreux auteurs tout en continuant à écrire pour la scène. Il contribue aussi un grand nombre d'articles à l’Encyclopédie universelle, au Supplément du Dictionnaire de la conversation, à l’Histoire des villes de France, au Moniteur, au Constitutionnel, à L'Illustration, à La Revue française, au journal Le Théâtre, dont il est rédacteur en chef de 1853 à 1855.
L’Académie française lui décerne le prix Halphen en 1866 pour l'ensemble de ses œuvres critiques et en 1881, sa veuve reçoit le prix Monbinne en mémoire des œuvres de son mari.
Publicité pour la collection « Le livre d'or des métiers » (1850-1852), à laquelle Fournier collabora.
Essai historique sur l'orthographe (1849)
Histoire des hôtelleries, cabarets, hôtels garnis, restaurants et cafés, et des anciennes communautés et confréries d'hôteliers, de marchands de vins, de restaurateurs, de limonadiers, etc., avec Francisque Michel, coll. « Le Livre d'or des métiers », 2 vol., illustrations d'Albert Racinet, Paris, éd. Seré, 1851 ; rééd. éd. Adolphe Delahays, 1858 — Texte en ligne 12.
Un prétendant portugais au XVIe siècle, lettre à M. M. D'Antas, sur Don Antonio, prieur de Crato, suivie d'études sur un prédicateur portugais à Paris en 1610, la Rosalinda et l'origine portugaise de la Fiancée du roi de Garbe (1851)
Histoire des cordonniers et des artisans dont la profession se rattache à la cordonnerie... depuis leur fondation jusqu'à leur suppression en 1789, précédée de l'histoire de la chaussure depuis les temps les plus reculés jusqu'à nos jours, avec Paul Lacroix et Alphonse Duchesne, coll. « Le Livre d'or des métiers », Paris, Seré, 1852.
Histoire de l'imprimerie et des arts et professions qui se rattachent à la typographie, comprenant l'histoire des anciennes corporations et confréries depuis leur fondation jusqu'à leur suppression en 1789, avec Paul Lacroix et Ferdinand Seré, coll. « Le Livre d'or des métiers », Paris, éd. Adolphe Delahays, 1852 — Lire sur Gallica.
Paris démoli, mosaïque de ruines, préf. de Théophile Gautier, Paris, éd. Auguste Aubry, 1855 — sur Gallica ; nouvelle édition augmentée, Paris, Dentu, 1883 — sur Gallica.
Les Lanternes. Histoire de l'ancien éclairage de Paris, suivi de la réimpression de quelques poèmes rares : Les Nouvelles Lanternes, 1755 [par de Valois d'Orville] ; Plaintes des filoux et écumeurs de bourses contre nosseigneurs les réverbères, 1769 ; Les Ambulantes à la brune contre la dureté du temps, 1769 ; Les Sultanes nocturnes, 1769 (1854)
Variétés historiques et littéraires, recueil de pièces volantes rares et curieuses en prose et en vers (10 volumes, 1855-1863)
Lettres inédites de la marquise de Créqui à Sénac de Meilhan, 1782-1789, mises en ordre et annotées par Édouard Fournier, précédées d'une introduction par Sainte-Beuve (1856)
Marie-Catherine-Hortense de Villedieu. Récit en vers et en prose de la farce des Précieuses (1856)
L'Esprit dans l'histoire, recherches et curiosités sur les mots historiques (1857) texte en ligne : bnamCNAMGallica
Histoire physique, civile et morale de Paris par Jacques-Antoine Dulaure, augmentée d'une notice sur Dulaure et continuée jusqu'à nos jours par Édouard Fournier (3 volumes, 1858)
Le Vieux-neuf, histoire ancienne des inventions et découvertes modernes (2 volumes, 1859)
Le Jeu de paume, son histoire et sa description, notice par M. Edouard Fournier, suivie d'un traité de la courte-paume et de la longue-paume, des biographies des principaux paumiers, etc. (1862)
Le Roman de Molière, suivi de fragments sur sa vie privée, d'après des documents nouveaux (1863) Texte en ligne
L'Art de la reliure en France aux derniers siècles (1864)
Chroniques et légendes des rues de Paris (1864) Texte en ligne
Les Tragédies de Sophocle, texte grec avec un commentaire critique et explicatif (1867)
Les Prussiens chez nous (1871)
Le Théâtre français au XVIe et au XVIIe siècle, ou Choix des comédies les plus curieuses antérieures à Molière, avec une introduction, des notes et une notice sur chaque auteur (1871)
Œuvres complètes de Nicolas Boileau, précédées de la vie de l'auteur d'après des documents nouveaux et inédits (1873)
Histoire de la butte des Moulins, suivie d'une étude historique sur les demeures de Corneille à Paris (1877)
Le Livre commode des adresses de Paris pour 1692 par Nicolas de Blégny, précédé d'une introduction et annoté par Édouard Fournier (2 volumes, 1878) Texte en ligne 12
Le Mystère de Robert le Diable, mis en deux parties, avec transcription en vers modernes en regard du texte du XIVe siècle, et précédé d'une introduction par Édouard Fournier (1879)
Souvenirs poétiques de l'école romantique, 1825 à 1840 (1880) Texte en ligne
