Bojan Bazelli a fait ses études à la FAMU de Prague. Impressionné par un des films d'étudiants de Bazelli, le réalisateurAbel Ferrara recruta ce dernier pour le tournage de son film China Girl, à New York. Bojan Bazelli continua à travailler avec Abel Ferrara par la suite, pour les films The King of New York et Body Snatchers. Il est un des rares directeurs de la photographie contemporains à avoir exercé cette fonction directement, sans commencer par d'autres rôles moins importants.
Bazelli reçut un Independent's Spirit Award en 1990 pour son travail sur The King of New York. Il a reçu un Clio Award de la meilleure photographie en 1998, et le film Kalifornia a reçu le prix de la Meilleure photographie au Festival de Montréal.