La Copa Sudamericana 2006 est la 5e édition de la Copa Sudamericana. Cette compétition internationale de football regroupe des clubs d'Amérique du Sud, ainsi que trois formations de la CONCACAF, invitées par la confédération sud-américaine. Le vainqueur rencontre le club sacré en Copa Libertadores 2006 lors de la Recopa Sudamericana.
La compétition se déroule en deux phases. Une phase préliminaire permet de désigner, par pays ou par groupe de pays, les équipes qui participeront à la phase finale. Certaines équipes sont directement qualifiées pour la phase finale sans participer à ces tours préliminaires. Pour la phase finale, les équipes qualifiées s'affrontent dans un schéma classique de tours éliminatoires avec matchs aller et retour des huitièmes de finale jusqu'à la finale.
La finale débouche sur une surprise puisque c'est le club mexicain du CF Pachuca, qui participe en tant qu'invité, qui s'impose face aux Chiliens de Colo-Colo. C'est le second titre international de Pachuca, qui compte une Ligue des champions de la CONCACAF à son palmarès, alors que Colo Colo dispute sa troisième finale sud-américaine. L'attaquant de Colo-Colo Humberto Suazo est sacré meilleur buteur de la compétition avec un total record de dix réalisations.
Ce titre de Pachuca est historique puisque c'est à ce jour la seule fois qu'une formation d'Amérique centrale remporte une compétition organisée par la CONMEBOL.
Participants
34 clubs de 12 pays différents - Argentine, Bolivie, Brésil, Chili, Colombie, Costa Rica, Équateur, Mexique, Paraguay, Pérou, Uruguay, Venezuela - participent à la Copa Sudamericana 2006. Le Mexique et le Costa Rica, qui font partie de la confédération nord-américaine de football, sont invités à prendre part à la compétition alors que les dix autres pays participent de droit à l'épreuve en tant que membres de la CONMEBOL. L'équipe argentine de CA Boca Juniors est qualifiée d'office en tant que tenant du titre. Les fédérations argentine et brésilienne envoient respectivement six (en plus de Boca Juniors) et huit représentants alors que les fédérations de football des autres pays envoient chacune deux équipes.
Clubs participants par tour d'entrée dans la compétition
Six équipes sont qualifiées d'office pour les huitièmes de finale et ne disputent pas cette phase préliminaire : il s'agit des Argentins du CA Boca Juniors (tenant du titre), du CA River Plate et du Gimnasia La Plata, des équipes mexicaines CF Pachuca et Deportivo Toluca ainsi que du LD Alajuelense en provenance du Costa Rica. La phase préliminaire se dispute entre le 22 août et le .
Premier tour
Les clubs engagés au premier tour affrontent l'autre formation du même pays.
↑Rencontre arrêtée à la 86e minute sur le score de 4-1 après que le joueur du Gimnasia La Plata Nicolás Cabrera ait été touché par un objet lancé depuis les tribunes. Le match n'est pas rejoué et le résultat est officialisé.
