La ville de Saint-Louis relève de l'académie de Strasbourg. Ses écoles sont gérées par la Direction de l'éducation de la mairie sous la supervision de l'inspection départementale de l'Éducation nationale. La commune fait partie des nombreuses villes acceptant actuellement l'application du service minimum à l'école lors des jours de grève de la fonction publique.
La municipalité Lauly prend possession à l'unanimité des voix, les locaux de la Manufacture nationale des tabacs (ancienne fabrique des cigares Vollmer situé rue du Temple) pour 195 000 francs (29 727,56 €) pour créer la première école maternelle de Saint-Louis, Sarasin
La construction d'une école maternelle est indispensable au quartier Wallart. Le , cette décision est approuvée. Près d'un million de Francs sont nécessaires à l'architecte colmarien François Riebert. Le , les travaux sont adjugés et achevés. En raison de la guerre, ce n'est que le 1er septembre1945 que les premiers enfants sont accueillis.
D'après le supplément du magazine Ludovie de , on y découvre un projet de quartier qui sera situé entre la rue du Docteur Hurst et l'avenue du Général de Gaulle. Il est stipulé qu'une nouvelle école maternelle sera construite. Il s'agira donc de la dixième de la ville.
Au début des années 1970, le nombre d'élèves en cycle secondaire augmente. La municipalité Bachmann demande alors la création d'un second collège à Saint-Louis pour 1973.
D'abord, l'emplacement proposé pour le nouveau collège de type 900 était un espace de friche industrielle de 2 hectares situé entre la rue du Rhône et la rue de Huningue, en amont de l'établissement Omega. Ensuite, la mairie a pensé à la rue du Ballon, à La Chaussée près du Stade de l'Au ou enfin, à la Cité du Rail. Finalement, c'est à Michelfelden que le collège sera bâti.
L'établissement a été construit sous les traits de l'architecte Knorr pour coûter 27 millions de francs (4,1 millions d'euros), dont 10 millions (1,5 million d'euros) accordés par l'État, 4 millions (610 000 euros) versés par le département et la ville payant le reste.
Lors de la rentrée 1984, 20 classes ont été créées et les professeurs ont été désignés. Mais les travaux n'étant pas finis, les 482 élèves ont été répartis dans le collège Gérard de Nerval de Village-Neuf - Huningue et dans le collège René Schickelé de Bourgfelden.
Le collège Georges Forlen a été inauguré officiellement le samedi en présence du président du Conseil Général Henri Goetschy, du préfet Mehdi Hacère et du recteur de l'Académie de StrasbourgPierre Deyon.
Saint-Louis ne possède qu'une école privée, l'école Emmanuel. Cette dernière qui a été créée en 1996 regroupe en elle-même une école maternelle et une école primaire. L'école est située dans la rue de la Fontaine, dans le mini-quartier de Neuf-Bourgfelden.
Listes des écoles
Ecole privée :
Saint-Louis - Centre : Emmanuel
Écoles maternelles publiques :
Saint-Louis - Centre : La Cigogne, Louis Armand, Sarasin, Wallart
