Après l'arrestation d'Augusto Pinochet à Londres en 1998, le général Brady est accusé d'être responsable de plusieurs disparitions forcées, dont celles des douze proches de l'ancien président Salvador Allende présents dans le Palais de la Moneda et assassinés près de Tacna (dont un franco-chilien, Georges Klein), celle de l'Américain Charles Horman(en) et celle du diplomate hispano-chilien Carmelo Soria[1]. Il a dès lors fait l'objet d'inculpations au Chili, en Espagne et en France, mais aucune procédure n’a abouti à sa condamnation.
Le général Ramírez Pineda, commandant de la division de Tacna et inculpé avec sept autres militaires par le juge Juan Carlos Urrutia, avait en effet invoqué des ordres venant d'Hermán Brady pour sa défense, menant à son inculpation en . Mais dès le , la Cour d'appel ordonne sa libération conditionnelle sous caution[1]. Le , elle confirme son inculpation pour homicide qualifié[1].
En 2008, la Cour d'appel ne condamne que trois officiers dans cette affaire, à des peines très légères (200 jours de prison avec sursis).
L'enquête est cependant rouverte concernant d'autres proches d'Allende présents à La Moneda le jour du coup d'État et assassinés à Tacna, dont Luis Fernando Rodríguez Riquelme, membre du Grupo de Amigos Personales(es) (GAP, la garde personnelle d'Allende créée par méfiance vis-à-vis de l'armée). En mai 2008, huit militaires, dont le général Brady et le brigadier-général Pedro Espinoza sont inculpés pour la disparition de celui-ci[2]. Malgré son hospitalisation courant 2010, la requête présentée par Brady pour échapper au procès concernant les détenus de la Moneda et les membres de la GAP, au motif de démence, est rejetée en par la Cour d'appel de Santiago[3].
Missing
Dès 1977, l'agent de renseignement chilien González Verdugo a accusé le général Brady d'être impliqué dans la disparition forcée de l'Américain Charles Horman[1], qui inspira le film de Costa-Gavras, Missing (1982). Une plainte a été déposée au Chili en 2000 pour cette affaire, avec, notamment, comme coïnculpés, Pinochet et Pedro Espinoza[4]. En 2006, l'affaire était toujours en cours.
Procès en Espagne
Auparavant Commandant en Chef de la garnison de Santiago, Hermán Julio Brady Roche a fait l'objet d'une plainte en Espagne pour l'assassinat du diplomate hispano-chilien Carmelo Soria en 1976, de membres du groupe Izquierda Unida, ainsi que de la torture et de l'assassinat des prêtres Juan Alsina et Antonio Llido Mengual (respectivement en 1973 et 1974), l'accusant de génocide et de terrorisme[5]. La Cour suprême chilienne avait clôt l'affaire Soria, suspendant toute poursuite, en 1996[6].
Cet arrêt est cependant cassé et annulé par le Tribunal Supérieur espagnol (TSE) le [5]. Celui-ci devait examiner la validité de la loi sur la compétence universelle promulguée par l'Espagne. En vertu du principe de compétence personnelle passive, à savoir la nationalité espagnole des victimes, le TSE a jugé compétente l'Espagne dans cette affaire, s'appuyant notamment sur l'arrêt du concernant le génocide au Guatemala[9]. En 2009, la justice espagnole décide de maintenir les poursuites contre le général Brady dans l'affaire Soria, inculpé aux côtés des responsables matériels de l'exécution, à savoir les membres de la Brigade Mulchen de la DINA (dont le général Raúl Iturriaga), et d'autres ex-ministres ou responsables militaires (le chef de la DINA Manuel Contreras, le brigadier-général Pedro Espinoza, etc.)[6].
À la suite d'une plainte déposée en France en 1998, après l'arrestation d'Augusto Pinochet à Londres, Brady Roche a été inculpé pour disparition forcée du franco-chilien Georges Klein. Le procès, qui concerne trois autres victimes et inclut le général Manuel Contreras, ex-chef de la DINA, s'est ouvert devant la cour d'assises de Paris en , en vertu du principe de compétence personnelle passive (à savoir la nationalité française des victimes), et non du principe de compétence universelle. Vivant en liberté au Chili, il comparaît par contumace.
Il meurt le à l'hôpital militaire de Santiago[10].
