Methanosarcina

Classification
Domaine	Archaea
Embranchement	Euryarchaeota
Classe	Methanomicrobia
Ordre	Methanosarcinales
Famille	Methanosarcinaceae

Methanosarcina est un genre d'archées méthanogènes anaérobies dont les espèces sont parmi les seules connues à pouvoir produire du méthane par les trois modes de la méthanogenèse^[2].

La plupart des méthanogènes, dits hydrogénotrophes, produisent en effet le méthane CH₄ par réduction du dioxyde de carbone CO₂ à l'aide de dihydrogène H₂, d'autres, dits acétotrophes, utilisent l'acétate CH₃COO^– par méthanogenèse acétotrophe, et les espèces du genre Methanosarcina sont également capables de métaboliser des composés organiques à un atome de carbone tels que le méthanol CH₃OH, le méthanethiol CH₃SH et la méthylamine CH₃NH₂ — elles sont dites méthylotrophes. Ces espèces sont par conséquent physiologiquement très diversifiées et présentes dans un très grand nombre d'environnements, allant des tas d'ordures aux eaux d'égouts en passant par les cheminées hydrothermales profondes et les eaux souterraines, ainsi que dans l'appareil digestif de nombreux ongulés (vaches, moutons, chèvres et cerfs) et jusque dans le tractus gastro-intestinal humain.

Le genre Methanosarcina présente également la particularité d'avoir des génomes de grande taille : M. acetivorans possède le plus grand génome archéen connu en 2011^[3], avec 5 751 492 bp^[4], suivi de près par celui de M. mazei, avec 4 096 345 bp. Ces organismes sont en outre capables de différenciation cellulaire^[2]^,^[5].

L'apparition de Methanosarcina et de la capacité de ces espèces à produire de grandes quantités de méthane a parfois été proposée pour expliquer l'extinction Permien-Trias survenue il y a environ 252 millions d'années^[6].

Notes et références

↑ (en) Référence NCBI : Methanosarcina (taxons inclus)
↑ ^{a et b} (en) James E. Galagan, Chad Nusbaum, Alice Roy, Matthew G. Endrizzi, Pendexter Macdonald, Will FitzHugh, Sarah Calvo, Reinhard Engels, Serge Smirnov, Deven Atnoor, Adam Brown, Nicole Allen, Jerome Naylor, Nicole Stange-Thomann, Kurt DeArellano, Robin Johnson, Lauren Linton, Paul McEwan, Kevin McKernan, Jessica Talamas, Andrea Tirrell, Wenjuan Ye, Andrew Zimmer, Robert D. Barber, Isaac Cann, David E. Graham, David A. Grahame, Adam M. Guss, Reiner Hedderich, Cheryl Ingram-Smith, H. Craig Kuettner, Joseph A. Krzycki, John A. Leigh, Weixi Li, Jinfeng Liu, Biswarup Mukhopadhyay, John N. Reeve, Kerry Smith, Timothy A. Springer, Lowell A. Umayam, Owen White, Robert H. White, Everly Conway de Macario, James G. Ferry, Ken F. Jarrell, Hua Jing, Alberto J.L. Macario, Ian Paulsen, Matthew Pritchett, Kevin R. Sowers, Ronald V. Swanson, Steven H. Zinder, Eric Lander, William W. Metcalf et Bruce Birren, « The Genome of M. acetivorans Extensive Metabolic and Physiological Diversity », Genome Research, vol. 12, n^o 4,‎ 2002, p. 532-542 (lire en ligne) DOI 10.1101/gr.223902 PMID 11932238
↑ (en) Vinay Satish Kumar, James G Ferry et Costas D Maranas, « Metabolic reconstruction of the archaeon methanogen Methanosarcina Acetivorans », BMC Systems Biology, vol. 5, n^o 28,‎ 15 février 2011 (lire en ligne) DOI 10.1186/1752-0509-5-28
↑ (en) Wim D'Haeze, « Methanogenic archaeon sequenced », Genome Biology, vol. 3, n^o 8,‎ 2002, p. 41 (lire en ligne) DOI 10.1186/gb-2002-3-8-reports0041
↑ (en) James A. Shapiro, « Thinking about bacterial populations as multicellular organisms », Annual Review of Microbiology, vol. 52, n^o 1,‎ octobre 1998, p. 81-104 (lire en ligne) DOI 10.1146/annurev.micro.52.1.81
↑ (en) XIE ShuCheng, YANG Huan, LUO GenMing, HUANG XianYu, LIU Deng, WANG YongBiao, GONG YiMing et XU Ran, « Geomicrobial functional groups: A window on the interaction between life and environments », Chinese Science Bulletin, vol. 57, n^o 1,‎ janvier 2012, p. 2-19 (lire en ligne) DOI 10.1007/s11434-011-4860-x

Liens taxinomiques :

(en) Methanosarcina sur LSPN
(en) Methanosarcina sur NCBI
(en) Methanosarcina sur Tree Of Life
(en) Methanosarcina sur Species2000
(en) Methanosarcina sur MicrobeWiki

Portail de la microbiologie

[1] (en) Référence NCBI : Methanosarcina (taxons inclus)

[10.1101/gr.223902-2] {a et b} (en) James E. Galagan, Chad Nusbaum, Alice Roy, Matthew G. Endrizzi, Pendexter Macdonald, Will FitzHugh, Sarah Calvo, Reinhard Engels, Serge Smirnov, Deven Atnoor, Adam Brown, Nicole Allen, Jerome Naylor, Nicole Stange-Thomann, Kurt DeArellano, Robin Johnson, Lauren Linton, Paul McEwan, Kevin McKernan, Jessica Talamas, Andrea Tirrell, Wenjuan Ye, Andrew Zimmer, Robert D. Barber, Isaac Cann, David E. Graham, David A. Grahame, Adam M. Guss, Reiner Hedderich, Cheryl Ingram-Smith, H. Craig Kuettner, Joseph A. Krzycki, John A. Leigh, Weixi Li, Jinfeng Liu, Biswarup Mukhopadhyay, John N. Reeve, Kerry Smith, Timothy A. Springer, Lowell A. Umayam, Owen White, Robert H. White, Everly Conway de Macario, James G. Ferry, Ken F. Jarrell, Hua Jing, Alberto J.L. Macario, Ian Paulsen, Matthew Pritchett, Kevin R. Sowers, Ronald V. Swanson, Steven H. Zinder, Eric Lander, William W. Metcalf et Bruce Birren, « The Genome of M. acetivorans Extensive Metabolic and Physiological Diversity », Genome Research, vol. 12, n^o 4,‎ 2002, p. 532-542 (lire en ligne) DOI 10.1101/gr.223902 PMID 11932238

[10.1186/1752-0509-5-28-3] (en) Vinay Satish Kumar, James G Ferry et Costas D Maranas, « Metabolic reconstruction of the archaeon methanogen Methanosarcina Acetivorans », BMC Systems Biology, vol. 5, n^o 28,‎ 15 février 2011 (lire en ligne) DOI 10.1186/1752-0509-5-28

[10.1186/gb-2002-3-8-reports0041-4] (en) Wim D'Haeze, « Methanogenic archaeon sequenced », Genome Biology, vol. 3, n^o 8,‎ 2002, p. 41 (lire en ligne) DOI 10.1186/gb-2002-3-8-reports0041

[10.1146/annurev.micro.52.1.81-5] (en) James A. Shapiro, « Thinking about bacterial populations as multicellular organisms », Annual Review of Microbiology, vol. 52, n^o 1,‎ octobre 1998, p. 81-104 (lire en ligne) DOI 10.1146/annurev.micro.52.1.81

[10.1007/s11434-011-4860-x-6] (en) XIE ShuCheng, YANG Huan, LUO GenMing, HUANG XianYu, LIU Deng, WANG YongBiao, GONG YiMing et XU Ran, « Geomicrobial functional groups: A window on the interaction between life and environments », Chinese Science Bulletin, vol. 57, n^o 1,‎ janvier 2012, p. 2-19 (lire en ligne) DOI 10.1007/s11434-011-4860-x

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Methanosarcina

Notes et références

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