Michael Alaalatoa joue dans un premier temps avec l'équipe de rugby du Newington College(en) de Sydney[5]. Il commence sa carrière en senior en 2013, lorsqu'il rejoint le club de Southern District qui évolue en Shute Shield (championnat de la région de Sydney)[6]. Il joue pendant une saison avec cette équipe, aux côtés de son frère Allan, disputant quinze rencontres[1]. Pendant cette période, il s'entraîne avec le groupe élargi de la franchise des Waratahs qui dispute le Super Rugby[7].
En 2014, il rejoint le club de West Harbour en Shute Shield[1]. Toujours dans le groupe élargi des Waratahs, il fait ses débuts professionnels le contre les Queensland Reds, pour ce qui est son unique match de la saison[8]. La même année, il fait ses débuts en National Rugby Championship avec l'équipe des NSW Country Eagles[9].
Après une saison 2015 où il ne joue aucun match avec les Waratahs, il décide de rejoindre la province néo-zélandaise de Manawatu en NPC afin de véritablement lancer sa carrière[5]. Après une saison convaincante avec Manawatu, où il joue tous les matchs en tant que titulaire, il est recruté par la franchise des Crusaders pour un contrat d'une saison[4],[10]. Malgré la présence de l'expérimenté All BlackOwen Franks, il joue quatorze rencontres lors de sa première saison (dont seulement une titularisation) et voit son contrat prolongé pour deux saisons supplémentaires[11]. Avec cette franchise, il remporte le Super Rugby en 2017, 2018 et 2019.
En 2019, il change de province de NPC et rejoint Canterbury[12]. Il ne reste cependant qu'une seule saison avec Canterbury avant de faire son retour à Manawatu pour la saison 2020[13].
Après six saisons chez les Crusaders, il décide en 2021 de rejoindre la province irlandaise du Leinster, évoluant en United Rugby Championship[14]. Pendant ses trois saisons avec cette équipe, il est essentiellement la doublure de l'international irlandais Tadhg Furlong[3],[15]. Il participe ainsi en tant que remplaçant aux trois finales de Champions Cup perdues par le Leinster[3].
Il est sélectionné pour la première fois avec l'équipe des Samoa au mois d' lorsqu'il est nommé dans le groupe pour disputer la Coupe du monde au Japon[18]. Il obtient sa première cape internationale avec l'équipe des Samoa le à l’occasion d’un test-match contre l'équipe d'Australie à Sydney[19]. Lors de la Coupe du monde, il dispute quatre matchs contre la Russie, l'Écosse, le Japon et l'Irlande[20].
En , il est nommé capitaine de la sélection pour la double rencontre face aux Tonga, qualificative pour la Coupe du monde 2023[21]. Les Samoans parviennent finalement à se qualifier, après l'avoir emporté largement lors des deux matchs[22].
En , il est annoncé au sein du groupe samoan retenu pour participer au Mondial 2023 en France[23]. Il se partage le rôle de capitaine avec Chris Vui lors de la compétition[24]. Il joue quatre matchs lors du tournoi, dont deux comme titulaire[3].