Elle a vécu entre la Californie et Hong Kong jusqu'à son déménagement dans la région de Los Angeles en 1974. Elle a 4 ans lorsque son père décède tragiquement en pleine gloire.
En 1994, Shannon épouse Ian Keasler, et ils ont une fille, prénommée Wren, en 2003.
En 2021, à la suite de l'accident de tir à Santa Fe et ayant perdu son frère Brandon Lee lors d'un accident de tournage en 1993, Shannon Lee plaide publiquement pour l'entrainement des acteurs au maniement des armes à feu[1].
