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Il est le fils de Philippe Audoin, écrivain surréaliste proche d'André Breton et le frère de Frédérique Audoin-Rouzeau alias Fred Vargas, archéozoologue et romancière, ainsi que de l'artiste peintre Joëlle Audoin-Rouzeau alias Jo Vargas[1]. Il est le petit-fils de Robert Audoin, sous-lieutenant d'artillerie pendant la Grande Guerre, et le père de l'écrivain Eloi Audoin-Rouzeau (1990).
Depuis 2004, il est directeur d'études à l'EHESS et, depuis 2011, directeur général du fonds de dotation de l'EHESS. Depuis 2010, il est également président du centre international de recherches de l'Historial de la Grande Guerre.
Il a inspiré le personnage de Lucien Devernois à sa sœur romancière dans Debout les morts : Lucien est comme lui un spécialiste de la Première Guerre mondiale, mèche noire en bataille, à l'inépuisable logorrhée[4].
Recherche
Apport à l'histoire de la Première Guerre mondiale
Avec Jean-Jacques Becker, président d'honneur du Centre de recherche de l'Historial, et Annette Becker, Stéphane Audoin-Rouzeau a fortement contribué à renouveler l'historiographie de la Première Guerre mondiale[1]. Il a défini avec d'autres historiens français, allemands et anglais le concept de « consentement patriotique » pour expliquer le fait que les populations européennes et les troupes aient massivement soutenu le déclenchement du conflit et soutenu le terrible effort de guerre des différents États belligérants, sans qu'il y ait de mouvements de révolte ou de contestation, excepté les vagues de mutineries de l'année 1917.
Apport à l'histoire du génocide des Tutsi au Rwanda
14-18 : retrouver la guerre, avec Annette Becker, Gallimard, 2000.
Cinq deuils de guerre 1914-1918, Éditions Noesis, 2001, Paris[7].
Un regard sur la Grande Guerre, Larousse, 2002.
photographies inédites du soldat Marcel Felser, préfacées et commentées par Audoin-Rouzeau
La violence de guerre : 1914-1945 : approches comparées des deux conflits mondiaux, textes de Henriette Asséo, Stéphane Audoin-Rouzeau, Omer Bartov… [et al.] , sous la direction de Stéphane Audoin-Rouzeau, Annette Becker, Christian Ingrao et Henry Rousso, Bruxelles et Paris, Éd. Complexe, Paris, IHTP, CNRS, 2002.
Encyclopédie de la Grande Guerre 1914 - 1918, collectif sous la direction de Jean-Jacques Becker et Stéphane Audoin-Rouzeau, Éditions Bayard, 2004.
Sortir de la grande guerre. Le monde et l'après-1918, Tallandier, coécrit avec Christophe Prochasson, 2008.
Cicatrices, Tallandier, coécrit avec Gerd Krumeich, 2008
L'enfant de l'ennemi : viol, avortement, infanticide pendant la Grande Guerre, Flammarion, 2013.
Combattre : une anthropologie historique de la guerre moderne (XIXe – XXIe siècle), Seuil, 2008.
Les armes et la chair : trois objets de mort en 14-18, Armand Colin, 2009.
La Grande Guerre des musiciens, Stéphane Audouin-Rouzeau, Esteban Buch, Myriam Chimènes, Georgie Durosoir (direction scientifique), Lyon, Symétrie, 2009, 256 p. (ISBN978-2-914373-54-8).
GAZ ! GAZ ! GAZ !, La Guerre chimique 1914-1918, 5 continents, 2010.
Quelle histoire : un récit de filiation (1914-2014), « Hautes Études » EHESS, Gallimard, Seuil, 2013, 146 p. (ISBN978-2-02-110445-5)[8]
Quelle Histoire : un récit de filiation (1914-2014), suivi d'un texte inédit Du côté des femmes, Points Histoire , 2015 (ISBN978-2-757-85452-5)
Avec Jean-Pierre Chrétien et Hélène Dumas, « Le génocide des Tutsi rwandais, 1994 : revenir à l’histoire », in Le Débat, no 167, novembre-, p. 61-71.
Avec Hélène Dumas, « Le génocide des Tutsi rwandais, vingt ans après : réflexions introductives », in Dossier : Le génocide des Tutsi rwandais, vingt ans après, in Vingtième siècle : revue d’histoire, no 122, avril-, p. 3-16.
« Chercheurs dans le prétoire : retour sur le procès Simbikangwa : un dialogue magistrat-historien », in Grief, no 3, 2014, p. 175-182
« La responsabilité de la France vue du Rwanda : le rapport Mucyo : une lecture historienne », in Esprit, , p. 122-134.