En 2001, il a fondé l’Association of Life-Giving Churches qui comptait 300 églises members en 2006[3].
En 2003, il devient président de la National Association of Evangelicals.
En 2005, le magazine Time le décrit parmi les « dirigeants religieux » influents auprès de la Maison Blanche[4]. Ainsi il a rencontré à plusieurs reprises le président George W. Bush à la Maison Blanche[5].
En 2006, Haggard a exprimé son soutien à un amendement empêchant le mariage homosexuel au Colorado, mais aurait soutenu les unions civiles pour les couples de même sexe[6].
Affaire sexuelle
Il est excommunié de l’église New Life en novembre 2006 et démis de ses fonctions de président de la National Association of Evangelicals à la suite d'accusations de relations sexuelles avec un homme prostitué et la consommation de méthamphétamine et ce pendant trois ans[7],[8].
En janvier 2009, les responsables de l'ancienne église de Haggard ont annoncé qu'un jeune membre de l'église s'était manifesté en 2006 et qu'ils avaient des preuves d'une relation sexuelle consensuelle inappropriée[9]. Le pasteur Brady Boyd a déclaré que l'Église était parvenue à un accord avec la victime[10]. Selon la victime, Haggard aurait fait un acte sexuel devant lui en 2006 et ce n’était pas consensuel[11].
En janvier 2011, ABC News diffuse le documentaire Ted Haggard: Scandalous qui présente l'affaire sexuelle qui a conduit Ted Haggard à démissionner de New Life[12].
En avril 2022, il a vendu l'entrepôt abritant l'église Saint James pour 1,95 million de dollars[14]. La vente a eu lieu après que de nouvelles allégations ont fait surface concernant les relations inappropriées de Haggard avec des garçons de l'église et une consommation de drogue[8].
Cette même année, il a fondé une nouvelle église à son domicile[15].