Il 13 febbraio 2018 è stato acquistato a titolo definitivo per 60.000 euro dalla squadra macedone dello Shkupi.
Il 1º settembre 2021 è stato reso noto il suo passaggio ai norvegesi dello Start con la formula del prestito.[1] Il 10 novembre, lo Start ha riscattato Ndong a titolo definitivo, col giocatore che ha firmato un contratto valido fino al 1º agosto 2024.[2]