Negli anni '70 e '80, durante il governo segregazionista del Partito nazionale Sudafricano, Ellis è stato aperto oppositore delle politiche di apartheid, ed è in quel periodo che ha concentrato le sue attenzioni sugli aspetti più filosofici della cosmologia, con ricerche che gli hanno fruttato il premio Templeton. Ellis è stato insignito della Gran Croce dell’Ordine della Stella del Sudafrica da Nelson Mandela, nel 1999. [3] Il 18 maggio 2007 è stato eletto Fellow della Royal Society. [4]
(con David Dewar), Low Income Housing Policy in South Africa, Urban Problems Research Unit, UCT, 1979.
(con Ruth Williams), Flat and Curved Space Times, Oxford University Press, 1988 (revised edition, 2000).
Before the Beginning: Cosmology Explained, Bowerdean/Marion Boyars, 1993.
(con A. Lanza and J. Miller), The Renaissance of General Relativity and Cosmology, University Press, Cambridge, 1993; paperback, 2005.
Science Research Policy in South Africa, Royal Society of South Africa, 1994.
(con Nancey Murphy), On The Moral Nature of the universe: Cosmology, Theology, and Ethics, Fortress Press, 1996.
(con John Wainwright) (Eds.), Wainwright, J. e Ellis, G.F.R. (a cura di), Dynamical Systems in Cosmology, Cambridge, Cambridge University Press, 1997, ISBN0-521-55457-8.
(con Peter Coles), Is The Universe Open or Closed? The Density of Matter in the Universe, Cambridge University Press, 1997.
(Ed.), The Far Future Universe, Templeton Foundation Press, 2002.
Science in Faith and Hope: an interaction, Quaker Books, 2004.