Nato a Lisbona con il nome di João Poinsot (in latino: Johannes Poinsot), era figlio di Pierre Poinsot e Maria Garcês. Suo padre, un fiammingo di lingua francese, fu segretario del cardinaleAlberto, Arciduca d'Austria, e sua madre era portoghese. Quando il padre fu costretto a seguire l'arciduca nei suoi viaggi a Madrid e nelle Fiandre affidò i figli João e Luiz a suo fratello maggiore, in Portogallo.
A 23 anni entrò nell'ordine domenicano, nel convento di Santa María Madrid Atocha, ove prese il nome religioso di Giovanni di San Tommaso, per fedeltà e devozione al Dottore Angelico san Tommaso d'Aquino. Lì fu ordinato presbitero.
Tra il 1625 e il 1630 insegnò filosofia e teologia al Colegio Complutense dei Domenicani, poi assunse una cattedra presso l'Università di Alcalá. Lasciò l'università nel 1643, e fu scelto come confessore di Filippo IV di Spagna. Morì il 6 giugno 1644, all'età di 55 anni.
Le sue opere non sono molte, ma le prime due sono lunghe e complesse:
Cursus philosophicus, 1663 (varie edizioni e in più volumi)
Cursus theologicus, 1643 (varie edizioni e in più volumi)
Misterios del Santo Rosario y modo de ofrecerle, Alcalá, 1644.
Práctica y consideración para ayudar a bien morir, Alcalá, 1645.
Breve tratado y muy importante para saber hacer una confesión general, Madrid, 1644.
Bibliografia
Giovanni di san Tommaso, Trattato sui segni. Testo latino a fronte a cura di Fernando Fiorentino, Milano, Bompiani, 2010.
Juan Poinsot, Del alma (1635) I, Juan Cruz Cruz (Ed.), EUNSA, Pamplona, 2005, ISBN 8431322586.
Orietta Filippini, La coscienza del re. Juan de Santo Tomas, confessore di Filippo IV di Spagna, Firenze, Olschi, 2006, 201 p. ISBN 978-88-222-5560-0
Orietta FilippiniI, "Juan de Santo Tomas o.p., confesor de Felipe IV de Espana '1643-1644)", in Benoît Pellistrandi, Chantal Grell, Les cours d'Espagne et de France au XVIIe siècle, Madrid, Casa de Velazquez, 2007. ISBN 978-84-95555-78-6
Marco Forlivesi, Conoscenza e affettività. L'Incontro con l'essere secondo Giovanni di San Tommaso, Edizioni Studio Domenicano, Bologna, 1993.
Iñigo García Elton, "La bondad y la malicia de los actos humanos según Juan de Santo Tomás (Juan Poinsot)", Cuadernos de Pensamiento Español, Navarra, 2010.
J. M. Ramirez, Jean de saint-Thomas, en Dictionnaire de Théologie Catholique, VIII/1, Letouzey et Ane, Paris, 1924, cols. 803-808.
