La Serie B 1998-1999 è stata la 9ª edizione della categoria nonché, con l'istituzione della Serie A2, la prima di terzo livello del campionato italiano di calcio a 5. La stagione regolare ha preso avvio il 10 ottobre 1998 e si è conclusa il 17 aprile 1999[1], prolungandosi fino al 12 giugno con la disputa delle partite di spareggio.
Girone A
Partecipanti
Il girone A comprende cinque società provenienti dalla Lombardia, due da Piemonte Toscana e Valle d'Aosta e la sola Polisportiva Giemme dall'Emilia-Romagna. Dai campionati regionali sono stati promossi l'Associazione Studenti Sportivi Università Bocconi, il Livorno 94[2] e il Club 5 Biella. Quest'ultimo durante l'estate ha assorbito i torinesi del Progetto Capricciosa, anch'esso neopromosso, per dare vita al Biella 1995[1]. In seguito alla fusione con il Cesana, anche il Real Ronchiverdi ha rinunciato all'iscrizione, così come la società vincitrice del campionato ligure. A completamento dell'organico sono stati ripescati Polisportiva Giemme (con sede a Reggio Emilia), Star Five (con sede a Settimo Torinese)[1], Virtus Gorle[3] nonché il retrocesso Futsal Aosta.
Morbegno, Polisportiva Giemme e Star Five retrocessi nei campionati regionali.
Futsal Aosta retrocesso dopo i play-out ma successivamente ripescato.
Girone B
Partecipanti
Il girone B comprende tre società provenienti dall'Emilia-Romagna e altrettante dalle Marche e dal Veneto, due dal Friuli-Venezia Giulia e una dal Trentino-Alto Adige. Tra le neopromosse, Arzignano, Borgonuovo e Monfalcone hanno vinto i rispettivi campionati regionali mentre la Luparense ha guadagnato la promozione tramite i play-off. La Virtus Don Bosco, vincitrice della Serie C del Trentino-Alto Adige[4], il Chiaravalle (ripartito dalla Serie C delle Marche) e la Team Sport Ancona (unitasi ai concittadini della Polisportiva Giampaoli[5]), non hanno presentato la domanda di iscrizione. A completamento dell'organico è stato ammesso il Palombina Nuova, sconfitto dal Miracolo Piceno nello spareggio promozione della Serie C marchigiana.
Il girone C comprende sette società provenienti dal Lazio, quattro dalla Sardegna e una dall'Umbria. Perugia e Real Sporting Club (con sede a Roma) hanno vinto i rispettivi campionati regionali. Il B&C Roma non ha presentato domanda di iscrizione, mentre il retrocesso Marino è stato ripescato a completamento d'organico.
Delfino Cagliari e, dopo i play-off, Ciampino promossi in Serie A2 1999-00.
Amatori Civitavecchia e Futsal Roma retrocessi nei campionati regionali.
Real Sporting Club non iscritto al campionato di Serie B 1999-00. Quartu 2000 e, dopo i play-out, CUS Viterbo retrocessi ma successivamente ripescati.
Girone D
Partecipanti
Il girone D comprende cinque società provenienti dalla Campania, due da Abruzzo e Marche e una ciascuna da Basilicata, Lazio e Molise. Il Miracolo Piceno ha vinto il campionato di Serie C delle Marche. Il girone lamenta ben quattro defezioni: Forza e Coraggio Avezzano e L'Aquila, nonché le vincitrici dei campionati regionali di Abruzzo e Molise, non hanno infatti presentato domanda di iscrizione.
Teate 94 e Torrac Potenza retrocessi nei campionati regionali.
San Benedetto e, dopo i play-out, Pro Calcetto Avezzano retrocessi ma successivamente ripescati.
Girone E
Partecipanti
Il girone E comprende sei società provenienti dalla Sicilia, quattro dalla Puglia e due dalla Calabria. Viagrande, Libertas Rutigliano e San Giovannello hanno vinto i rispettivi campionati regionali. Il Villeneuve Barletta non ha presentato domanda di iscrizione mentre il retrocesso Centro Sportivo La Quercia è stato ripescato a completamento d'organico.