Il suo debutto nel mondo dei fumetti avviene nel 1987, con la pubblicazione della miniserieKafka, disegnata da Stefano Gaudiano e pubblicata da Renegade Comics, la quale riceve una nomination come miglior miniserie agli Eisner Award. Ad essa seguono Jaguar Story, disegnata da Mike Allred e mai pubblicata, The Amazon, disegnata da Tim Sale e pubblicata dalla Comico, e Solstice, disegnata Justin Norman e Moritat e pubblicata prima dalla Watermark Press e poi dalla Image Comics.
Comincia a lavorare per la Vertigo nel 1993, creando con Matt Wagner e Guy Davis la serie Sandman Mystery Theatre e, nel 1996, House of Secrets; quest'ultima segna l'inizio del sodalizio con il disegnatore danese Teddy Kristiansen. Grazie ai suoi lavori per la Vertigo ottiene l'incarico di scrivere le serie Alpha Flight e Uncanny X-Men per la Marvel Comics, che abbandonerà per divergenze creative[1]. Durante il periodo alla Marvel conosce lo sceneggiatore Joe Kelly, stringendo con questi una forte amicizia[1]. Con quest'ultimo, Joe Casey e Duncan Rouleau fonda nel 2000 il Man of Action Studios, cominciando la sua carriera di produttore e sceneggiatore al di fuori dell'ambito fumettistico, curando lo script del videogioco X-Men Legends della Activision e creando per Cartoon Network le serie Ben 10 e Generator Rex.
Nel 2004 dà vita alla graphic novel È un aereo... disegnata da Teddy Kristiansen e pubblicata da Vertigo, che ottiene un buon riscontro da parte della critica ed una vittoria agli Eisner Award nella categoria miglior pittore/pagine interne. Sempre sotto l'etichetta Vertigo pubblica nel 2006 la serie American Virgin, disegnata da Becky Cloonan e cancellata 2008.
Nel 2014 esce nelle sale il classico DisneyBig Hero 6, liberamente ispirato all'omonima serie a fumetti creata dallo stesso Seagle e Duncan Rouleau nel 1998 per la Marvel Comics[2]. Tuttavia, i due scrittori non vengono menzionati nell'edizione Blu-Ray del film e nel libro Art of Big Hero 6, cosa che porta lo sceneggiatore a criticare entrambi i prodotti[3].
Superman/Batman #75: "It's a Bat..." (con Teddy Kristiansen, 2010)
Vertigo
Sandman Mystery Theatre #13–70 + Annual #1 (con Matt Wagner (#13–60), Guy Davis (art: #13–32, 37–44, 49–56, 61–70), Warren Pleece (art: #33–36), Matthew Dow Smith (art: #45–48), Michael Lark (art: #57–60) e Paul Rivoche (art: Winter's Edge #2), 1994–1999)
House of Secrets (con Teddy Kristiansen, Duncan Fegredo (#6), D'Israeli (#16) e Pander Brothers (#20))
Heartthrobs #1: "Diagnosis" (con Tim Sale, antologia, 1999)
Flinch #9: "Sitter!" (con John Estes, antologia, 2000)
Alpha Flight v2 #−1, 1–20 e Annual '98 (con Anthony Winn (art: #−1 and 10), Scott Clark (art: #1–5 and 7–8), Bryan Hitch (art: #6), Roger Cruz (art: #9), Joe Casey (plot: #11 and Annual '98), Tom Raney (art: Annual '98), Ariel Olivetti (art: #11), Duncan Rouleau (art: #12 and 14–20; script: #17–20) e Ashley Wood (art: #13), 1997–1999)
X-Men v2 #68: "Heart of the Matter" (con Scott Lobdell e Pasqual Ferry, 1997)
Uncanny X-Men #350–365 (con Scott Lobdell (plot: #350), Joe Madureira (art: #350), Ed Benes (art: #351), Cully Hamner/Tommy Lee Edwards/Darryl Banks/Terry Dodson/J. H. Williams III/John Cassaday (art: #352), Chris Bachalo (art: #353–356, 358–360, 362–363 and 365), Dan Norton (art: #357), Joe Harris (script: #358), Joe Kelly (script: #359), Steve Skroce (art: #361), Ralph Macchio (script: #364) e Leinil Francis Yu/Pasqual Ferry (art: #364), 1997–1999)
X-Men: The Hunt for Professor X (2015)
X-Men: The Trail of Gambit (2016)
X-Men: Blue (2017)
Image Comics
Soul Kiss #1–5 (con Marco Cinello, 2009)
Frankie Stein (con Marco Cinello, graphic novel, 48 pagine, 2010)