Debuttò nella scena agonistica ai campionati nazionali di atletica della Germania Est nel 1975, arrivando al primo posto nella propria specialità dei 110 m ostacoli. Alle successive Olimpiadi di Montréal 1976 si qualificò per la finale arrivando al quinto posto,[1] e l'anno dopo conquistò la prima posizione sia in Coppa Europa che in Coppa del mondo.
Alla notizia del boicottaggio del proprio paese, la Germania Est, alle Olimpiadi di Los Angeles 1984, Thomas Munkelt decise di ritirarsi dall'attività agonistica.