menjelang tahun 2025 menjadi program studi yang unggul dan kompetitif dalam menghasilkan sumber daya manusia dan riset berskala nasional berbasis biodiversitas dan biogeografi kepulauan.

1.    melaksanakan pembelajaran dan pembimbingan secara efektif dan kondusif yang didukung oleh sdm yang memiliki kompetensi tinggi.

2.   meningkatkan kualitas program studi sesuai standar nasional pendidikan tinggi indonesia.

3.   menghasilkan lulusan yang mampu memecahkan berbagai permasalahan biologi terutama biogeografi dan biodiversitas kepulauan.

4.   melaksanakan penelitian dan pengabdian kepada masyarakat yang unggul dan kompetitif pada bidang iptek biologi terutama biogeografi dan biodiversitas kepulauan.

5.   mewujudkan program studi biologi fmipa universitas pattimura sebagai pusat kajian dan informasi data biogeografi dan biodiversitas kepulauan    

program studi biologi fmipa unpatti secara spesifik akan melahirkan lulusan dapat terserap dalam beberapa bidang kerja seperti: industri, balai pengawasan obat dan makanan (bpom), lembaga ilmu pengetahuan indonesia (lipi), bidang pendidikan (dosen dan guru), wirausaha, laboratorium kesehatan, pemerintah daerah kabupaten / kota / propinsi, dan lainnya. beberapa lulusan juga melanjutkan studi di universitas ternama di dalam negeri dan luar negeri.