В устной традиции годоберинцев существует несколько легенд об образовании слова «годобери». Согласно одной из легенд, первые поселенцы этих мест - братья-охотники (чанахъан). Они, по преданию, были меткими стрелками, способными поразить стрелой в глаз летящего ворона. Таким образом, слово "годобери" происходит от аварского гъеду «ворона» и бер «глаз» (букв. - «вороний глаз»).
Другая легенда гласит, что первые поселенцы остановились в местности под названием Гъеду (Гъиду), отсюда и происходит название этнонима "гъибдиди" (годоберинцы) и ойконима "Гъиду" (Годобери).[5]
Годобери - одно из трех годоберинских сел в Ботлихском районе[3].
История
Образовано Указом ПВС ДАССР от 17.08.1989 г. путём объединения сел Верхнее и Нижнее Годобери.
В селе родился Герой Российской Федерации Дибиргаджи Магомедов, в период Второй чеченской войны руководивший обороной Годобери от чеченских сепаратистов.