Предполагается, что гаплогруппа D возникла в Азии около 60 тыс. лет тому назад. Она является потомком гаплогруппы M.
По оценке Н. В. Володько, митохондриальная гаплогруппа D4h3 возникла на Дальнем Востоке около 17 тыс. лет назад[2][3].
Филогенетическое дерево
D
D4
D1
D1a
D1b
D1c
D1d
D4a
D4a1
D4a1a
D4a1b
D4a1c
D4a2
D4a2a
D4a3
D4a3a
D4a4
D4b
D4b1
D3
D4b1a
D4b1a1
D4b1a2
D4b1a2a
D4b1a2a1
D4b1a2a1a
D4b1b
D4b1b1
D4b1b1a
D4b1b2
D4b2
D4b2a
D4b2a1
D4b2a2
D4b2a2a
D4b2a2b
D4b2b
D4b2b1
D4b2b1a
D4b2b1b
D4b2b2
D4b2b3
D4c
D4c1
D4c1a
D4c1a1
D4c1b
D4c1b1
D4c2
D4d
D4e
D4e1
D2
D2a
D2a1
D2a1a
D2a1b
D2b
D4e1a
D4e1a1
D4e1a2
D4e2
D4e2a
D4e2b
D4e2c
D4f
D4g
D4g1
D4g1a
D4g1b
D4g1c
D4g2
D4g2a
D4g2a1
D4h
D4h1
D4h1a
D4h3
D4i
D4i1
D4i2
D4j
D4k
D4l
D4l1
D4l2
D4l2a
D4m
D4m1
D4m2
D4n
D4n1
D4o
D4o1
D4o2
D5’6
D5
D5a’b
D5a
D5a1
D5a1a
D5a2
D5a2a
D5a2a1
D5a2a1a
D5a2a1b
D5b
D5b1
D5b1a
D5b1b
D5b1b1
D5b2
D5c
D5d
D5d1
D6
Распространение
Встречается в Северо-Восточной Азии (в том числе в Сибири). Также является одной из 5 мтДНК-гаплогрупп, обнаруженных у коренных народов Америки[4], наряду с такими, как A, B, C и X2a. D1 это базальная ветвь D4, которая широко распространена и разнообразна в Северной и Южной Америке. Субклады D4b1, D4e1 и D4h встречаются как в Азии, так и в Северной и Южной Америке. D2, встречается с высокой частотой в некоторых арктических и субарктических популяциях (особенно у алеутов) и является подклассом D4e1, параллельным D4e1a и D4e1c, поэтому его правильно следует называть D4e1b. D3 был найден главным образом в некоторых сибирских популяциях и у эскимосов Канады и Гренландии и является ветвью D4b1c.
Также гаплогруппа D довольно часто встречается в Центральной Азии[5], где она является второй по частоте кладой мтДНК (после митохондриальной гаплогруппы H). С низкой частотой гаплогруппа D встречается на северо-востоке Европы и в Юго-Западной Азии.
У монголов Китая митохондриальная гаплогруппа D достигает 27,07 %, у китайцев-хань — 23,53 %, у монголоязычных дауров — 10,53 %. Митохондриальная гаплогруппа D выявлена у 3 из 10 изученных в Китае носителей тунгусского языка[6].
Палеогенетика
D1 определена у девочки-подростка из пещеры Хойо Негро (полуостров Юкатан), жившей 13—12 тыс. лет назад[7][8]
D4h3a определена у мальчика Анзик-1 (en:Anzick-1), жившего 12,7 тыс. лет назад[9]
В Южном конусе Южной Америки в раннем голоцене была распространена митохондриальная гаплогруппа D1j, в среднем голоцене — митохондриальная гаплогруппа D1g[11]
D1j определили у образца LLP.S2.E1 (Laguna Chica, 10 223—9764 л. н.) из Аргентины[12]
D4h3a определили у образцов из бразильских Lapa do Santo возрастом ок. 9,5 тыс. л. н., Moraes возрастом ок. 5,8 тыс. л. н. и у образца из белизского Mayahak Cab Pek (ок. 9,3 тыс. л. н.)[15]
D4j определили у образца KPT005 (4142—3980 л. н., ранний бронзовый век) из могильника Khaptsagai у деревни Люры (Иркутская область)[24]
D2a1a определена у древних алеутов с Алеутских островов (от 2320—1900 до 500—140 л. н.)[25]
D2a1 обнаружена у представителя палеоэскимосской культуры Саккак, жившего в Гренландии ок. 4 тыс. лет назад[26]
D4b2b обнаружена у образцов JJD301.1 и JJD301.6 (3300 л. н.) из китайской пещеры Яндзиапо (Yangjiapo Cave)[16]
D5a1a2ab определена у образца FY-HT-1 (2510±140 л. н.) из китайской пещеры Фуянь (en:Fuyan Cave)[16]
Митохондриальная гаплогруппа D была обнаружена у мужчины-воина из погребения в Покровске (Якутия), жившего 2400—2200 лет назад[27]
У представителей среднего периода Яёй определили субклады D4b2b1 (образцы из Doigahama DH-S01 (2,306—2,238 тыс. л. н.) и DH-A) и D4b2a1 (образец HN-SJ002, Hanaura, Япония)[28].
У мужчины и женщины хунну из Duurlig Nars в Северо-Восточной Монголии, живших 2000 л. н., определили субклад D4[29]
D1g5 определили у образца LCH.E4.4 (Laguna Chica, 1627—1565 л. н.) из Аргентины[12]
Урджарская принцесса из погребения сакского времени (III—IV век до н. э.) в Урджарском районе Восточно-Казахстанской области имела субклад D4o[30][31]
Исследование ДНК скелета гуннского периода из Музея естественной истории (г. Будапешт), датированного средней третью V века, показало, что он имел субклад D4j12[31]
D2a1 определили у образцов токаревской культуры (вторая половина 1 тыс. до н. э. — начало 1 тыс. н. э.) со стоянки Ольская на мысе Восточный (Ольский) (Магаданская область)[24]
D5c1a определили у образца имперского периода Кофун JpIw31 (1303—1377 л. н.)[32].
↑Volodko N. V., Starikovskaya E. B., Mazunin I. O. et al., 2008. Mitochondrial diversity in Arctic Siberians, with particular reference to the evolutionary history of Beringia and Pleistocenic peopling of the Americas // American Journal of Human Genetics. Vol. 82. № 5. P. 1084–1100.
↑Natalia V. Volodko, Elena B. Starikovskaya, Ilya O. Mazunin et al., «Mitochondrial Genome Diversity in Arctic Siberians, with Particular Reference to the Evolutionary History of Beringia and Pleistocenic Peopling of the Americas», The American Journal of Human Genetics 82, 1084—1100, May 2008. DOI 10.1016/j.ajhg.2008.03.019.
↑Roca-Rada Xavier et al. Ancient mitochondrial genomes from the Argentinian Pampas inform the peopling of the Southern Cone of South America // ISBA9 (PDFАрхивная копия от 16 октября 2021 на Wayback Machine
↑Rasmussen, M. et al., «Ancient human gonome sequence of an extinct Palaeo-Eskimo». Nature 463: 757—762.
↑Amory S, Crubézy E, Keyser C, Alekseev AN, Ludes B (October 2006). «Early influence of the steppe tribes in the peopling of Siberia». Human Biology 78 (5): 531-49.