Частина інформації в цій статті застаріла. Ви можете допомогти, оновивши її. Можливо, сторінка обговорення містить зауваження щодо потрібних змін.(липень 2018)
На парламентських виборах 1998 року партія брала участь у складі блоку «За правду, за народ, за Україну!» разом із СПУ. Блок набрав близько 8,5 % голосів виборців (3 місце), отримавши 29 мандатів, 6 кандидатів від блоку було обрано за мажоритарними округами. Фракція СелПу у Верховній раді 3-го скликання налічувала 14 депутатів.
2001 СелПУ ініціювала акцію «Слободану Милошевичу — свободу!» на підтримку тодішнього голови Югославії Слободана Милошевича.
На парламентських виборах 2002 року партія брала участь самостійно і набрала 0,37 % голосів виборців. Жоден з кандидатів від партії не був обраний і на мажоритарних округах.
22 листопада2008 року керівником партії обрано Зеновія Холоднюка. Відповідне рішення ухвалене на третьому етапі ІХ позачергового з'їзду Селянської партії України.
18 грудня2011 року Селянська партія України на чолі з Зиновієм Холоднюком разом із іще чотирма партіями оголосила про приєднання до СПУ шляхом підписання Меморандуму про об'єднання лівих і лівоцентристських партій[2].
8 вересня2012 року ХІ позачерговому з'їзді Селянської партії України на чолі з керівником партії Зиновієм Холоднюком прийнято рішення про вихід з об'єднання із Соціалістичною партією України. Було прийнято рішення про підтримку Селянською партією України на парламентських виборах 2012 року Української партії «Зелена планета».