1 Compétitions officielles nationales et internationales senior, incluant le parcours amateur et en équipe réserve. 2 Matchs officiels. Dernière mise à jour :
Il débute en tant que professionnel en 2006 avec le club de Cobreloa.
Universidad de Chile
Le 6 janvier 2010, il s'engage avec la U pour 500 000 euros, il débute le 29 février face au Cobresal. En 2011, ce fut l'année révélatrice pour Vargas, dirigé par Jorge Sampaoli, il devient très vite un élément indiscutable au sein de l'effectif Azul, il devient meilleur buteur de la Copa Chile, meilleur joueur du championnat, meilleur attaquant du championnat, meilleur buteur et de la Copa Sudamericana, meilleur joueur de la Copa Sudamericana, ballon d'or du championnat et termine deuxième au titre du meilleur joueur sud américain derrière Messi Il attire alors l'attention de plusieurs clubs européen comme Manchester City, Chelsea, Arsenal Football Club, Valence FC, l'Inter Milan, SSC Naples et le Milan AC.
Naples
En décembre 2011, il choisit de signer avec SSC Naples pour environ 13 millions d'euros[1].
Prêt au Brésil
En janvier 2013, en manque de temps de jeu, le SSC Naples le prête au Grêmio jusqu'à la fin de la saison[2].
Prêt en Espagne
En janvier 2014, il est prêté au Valence CF jusqu'à la fin de la saison[3].
Prêt en Angleterre
Le 21 août 2014, Eduardo Vargas est prêté un an aux Queens Park Rangers. Le , il marque un doublé face à Liverpool.
TSG Hoffenheim
Le 24 août 2015, il s'engage pour quatre ans avec le TSG Hoffenheim contre 6 millions d'euros[4].
