Transféré au VfB Stuttgart durant l'été 1994, il marque dès son premier match de Bundesliga, contre Hambourg (2-1).
En 1997, pour remplacer Jürgen Klinsmann sur le départ, le Bayern Munich engage Elber, également convoité par le PSG, pour un peu plus de 6 M€. Le , le Brésilien bat le record du but le plus rapide du championnat allemand en trompant Golz, le porter de Hambourg SV, dès la 11e seconde du match. En , il est victime d'une déchirure des ligaments extérieurs du genou gauche l'éloignant plusieurs semaines des terrains. En , il remporte sa seule Ligue des champions en battant le FC Valence (1-1 tab 5-4). Il dispute son dernier match avec le Bayern, contre Hambourg (2-0), le en inscrivant son 133e but en 256 matchs en Allemagne[1].
Il est transféré en 2003 à l'Olympique lyonnais, avec lequel il remporte le championnat de France en 2003/2004. Après une première saison assez satisfaisante (10 buts en 27 matchs de championnat), Élber se blesse à l'entame de sa seconde saison lyonnaise. Cette blessure signifie la fin de son aventure en France, car le joueur va entrer en désaccord avec le médecin sur la gestion de sa blessure et notamment le fait qu'il soit parti au Brésil se faire soigner. Son contrat est alors résilié à l'amiable et Élber quitte la France pour retourner jouer en Allemagne.
Il signe au Borussia Mönchengladbach, pour un dernier défi dans la Bundesliga qui l'a vu devenir un footballeur d'envergure internationale.
Il revient ensuite au Brésil, et joue avec le Cruzeiro EC. Mais, fin 2006, il annonce raccrocher définitivement les crampons, à la suite de douleurs chroniques de plus en plus importantes[2].
Lors du Mondial juniors 1991, le Brésil dispute la finale à Lisbonne contre le Portugal. Au terme d'une rencontre sans but, les locaux l'emporte aux tirs au but (0-0 tab 4-2), même si Elber réussit sa tentative[1].
Le , Elber signe sa première sélection avec la Seleçao contre l'Argentine (0-2) en remplaçant Ronaldinho à la mi-temps[1].
Élber possède 15 sélections en équipe du Brésil (7 buts marqués) entre 1998 et 2001.
L'association des joueurs de football sous contrat (VDV) a honoré le Joueur de l'année de 1998 à 2003 et le Joueur de la saison chaque année depuis la saison 2005-2006.
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